结论：农村屋顶安装光伏影响后院采光是否合法，需结合具体情况判断，主要涉及相邻权、规划许可及地方性法规等因素。以下从不同角度详细分析：

1. 相邻权角度：是否构成采光权侵害

根据《民法典》第二百九十三条：“建造建筑物，不得违反国家有关工程建设标准，妨碍相邻建筑物的通风、采光和日照。”

• 核心判断标准：若光伏设备（如支架、太阳能板）的高度、角度或安装位置导致后院日照时间显著减少（如低于当地规定的最低日照标准），可能构成对相邻方采光权的侵害。
  
• 例外情形：若光伏设备符合国家或地方标准（如《民用建筑设计统一标准》中关于日照间距的规定），且未超出合理使用范围（如农村自建房通常允许一定程度的遮光），则可能不构成违法。
  
• 建议：可委托专业机构测量后院日照时长，对比当地标准，若不达标可要求对方调整或拆除。

2. 规划许可角度：是否取得合法审批

• 农村自建房光伏安装要求：根据《分布式光伏发电项目管理暂行办法》及地方规定，安装光伏需向当地电网企业备案，并可能需取得规划、建设等部门许可（尤其是涉及建筑结构改造时）。
  
• 违法情形：若未取得许可擅自安装，或安装位置违反规划要求（如超出屋顶边界、影响消防通道等），可能被认定为违法建设，需拆除或整改。
  
• 建议：核查对方是否持有合法审批文件，若无则可向乡镇政府或自然资源部门举报。

3. 地方性法规角度：特殊限制

部分地区对农村光伏安装有额外规定，例如：

• 高度限制：如某省规定“屋顶光伏设备高度不得超过屋顶最高点1.5米”；
  
• 间距要求：如要求光伏板与相邻建筑保持一定距离，避免遮光；
  
• 集体协商：部分村庄通过村规民约要求光伏安装需经邻居同意。
  
• 建议：查询当地政策或咨询村委会，确认是否存在特殊限制。

4. 争议解决途径

若协商无果，可通过以下方式维权：

1. 调解：向村委会、乡镇司法所申请调解；
   
2. 行政投诉：向自然资源、住建部门举报违法建设；
   
3. 诉讼：以“相邻权纠纷”为由起诉，要求停止侵害、赔偿损失（需提供日照测量报告等证据）。

5. 实务建议

• 预防措施：安装前与邻居沟通，签订书面协议明确权利义务；
  
• 合规安装：选择正规企业，确保设备符合标准并取得审批；
  
• 保留证据：安装前后拍摄照片、视频，记录日照情况。

总结：农村屋顶光伏是否影响采光合法性需综合判断，建议优先通过协商或调解解决。若涉及复杂法律问题（如地方性法规适用、证据收集等），可直接向我咨询，我会结合具体案情提供进一步分析。