关于路边停车ETC扣费是否合法的问题，这主要取决于当地的政策规定以及停车场与车主之间的合同约定。
首先，从政策层面来看，一些地方政府为了提升停车管理的效率和便捷性，会鼓励或要求停车场采用ETC等无感支付方式。例如，交通运输部办公厅就曾发布过关于开展ETC智慧停车城市建设试点工作的通知，鼓励停车场更多应用ETC无感缴费。在这种情况下，如果停车场按照政府要求进行了ETC无感支付升级改造，并且明确告知了车主，那么ETC扣费就是合法的。
其次，从合同层面来看，停车场与车主之间通常会签订停车服务合同，明确双方的权利和义务。如果合同中明确规定了可以使用ETC进行扣费，并且车主在停车时已经同意了这一条款，那么ETC扣费也是合法的。反之，如果合同中没有规定ETC扣费，或者车主没有同意使用ETC进行扣费，那么停车场就不能强制使用ETC进行扣费。
以您提供的两个案例为例：
在南县的案例中，智慧停车收费是严格依据当地政府发布的实施细则和发改部门核定的标准执行的。同时，工作人员也解释了ETC扣费机制，即车辆驶离泊位后系统生成订单，扣费需满足车主已绑定ETC账户并授权扣费功能，且扣费前会通过短信或智慧停车App推送通知。这说明南县的ETC扣费是合法且透明的。
在宁国市的案例中，虽然合同中没有明确规定使用ETC进行扣费，但宁国泊车为了提升停车管理的效率和便捷性，对部分路边停车泊位进行了ETC无感支付升级改造，并明确告知了车主。同时，宁国泊车也提供了其他缴费方式供车主选择，如现金缴费等。这说明宁国泊车的ETC扣费行为虽然超出了合同范围，但并未侵犯车主的合法权益，且提供了合理的解决方案。
综上所述，路边停车ETC扣费是否合法，需要看当地政策规定和停车场与车主之间的合同约定。如果政策允许且合同中有明确规定，或者车主已经同意使用ETC进行扣费，那么ETC扣费就是合法的。如果车主对ETC扣费有疑问或不满，可以向相关部门或停车场管理方进行咨询或投诉。