合同纠纷中的案由是由法院在立案时确定的，这一过程与被告无直接关系，但案由的确定可能会影响后续的诉讼程序和双方的权利义务。以下是对这一问题的详细解释：
案由的确定主体与时间：
- 确定主体：案由是由法院根据原告的诉讼请求、事实理由以及相关法律法规来确定的。法院在审查起诉材料时，会根据案件的性质、法律关系等因素，为案件确定一个合适的案由。
- 确定时间：案由通常在立案时确定。原告在提交起诉状时，虽然会初步提出自己的诉讼请求和事实理由，但最终的案由是由法院在立案审查过程中确定的。
案由确定与被告的关系：
- 无直接关系：案由的确定主要是基于原告的诉讼请求和案件事实，与被告无直接关系。被告在收到起诉状后，会针对原告的诉讼请求和事实理由进行答辩，但被告的答辩内容通常不会直接影响案由的确定。
- 间接影响：虽然被告的答辩不会直接影响案由的确定，但被告的答辩可能会揭示出案件的新事实或法律关系，从而在后续诉讼过程中影响法院对案由的理解或调整。不过，这种调整通常是在立案后，通过庭审或证据交换等程序进行的，且相对较少见。
案由确定的重要性：
- 指导诉讼程序：案由的确定有助于法院明确案件的性质和法律关系，从而指导后续的诉讼程序，如证据交换、庭审辩论等。
- 影响双方权利义务：不同的案由可能涉及不同的法律法规和司法解释，从而影响双方当事人的权利义务。例如，在某些合同纠纷中，案由的确定可能决定了原告是否有权要求被告承担违约责任或赔偿责任。
实际操作中的注意事项：
- 原告应准确陈述事实理由：原告在提交起诉状时，应尽可能准确、全面地陈述案件事实和理由，以便法院能够正确确定案由。
- 被告应积极应诉答辩：被告在收到起诉状后，应积极应诉答辩，针对原告的诉讼请求和事实理由提出自己的抗辩意见和证据，以维护自己的合法权益。
- 双方可关注案由调整：在诉讼过程中，如果双方发现案由可能存在误解或需要调整的情况，应及时向法院提出申请或意见，以便法院能够根据实际情况对案由进行适当调整。
总结来说，合同纠纷中的案由是由法院在立案时根据原告的诉讼请求和案件事实来确定的，与被告无直接关系。但案由的确定对后续的诉讼程序和双方的权利义务具有重要影响。因此，在合同纠纷诉讼中，双方应关注案由的确定问题，并积极配合法院的诉讼程序。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。