结论：国企对员工因行政拘留三日处罚进行留置，并不一定意味着是在调查阶段，留置的性质和目的可能因具体情况而异。以下是对此问题的详细分析：

1. 留置的性质与目的：

   • 留置并非一个严格的法律术语，在国企管理中，它可能指的是一种临时性的管理措施，用于对涉嫌违规或违法的员工进行进一步的调查或处理。
   • 留置的目的可能是为了确保调查的顺利进行，防止员工在调查期间逃避责任或干扰调查，但也可能涉及其他管理目的，如等待进一步的处理决定等。

2. 行政拘留与留置的关系：

   • 行政拘留是公安机关对违反治安管理行为人依法采取的短期限制人身自由的行政处罚。它是对违法行为的一种直接制裁，与留置在性质上有所不同。
   • 国企对员工进行留置，并非因为员工被行政拘留本身，而是可能基于员工涉嫌其他违规或违法行为，需要进一步调查。行政拘留可能只是触发留置的一个因素，但并非决定性因素。

3. 留置是否在调查阶段：

   • 如果留置是为了对员工涉嫌的违规或违法行为进行进一步调查，那么可以认为留置是在调查阶段。但这一阶段并非由行政拘留直接决定，而是由国企内部的管理规定和调查程序决定。
   • 然而，留置也可能发生在调查之后，作为对员工处理前的一种临时措施。例如，在调查结束后，国企可能需要时间来决定如何处理员工，此时可能会选择留置员工以等待处理决定。

4. 法律建议与注意事项：

   • 对于员工而言，如果因行政拘留而被国企留置，应首先了解留置的具体原因和目的。如果认为留置不当或侵犯了自己的合法权益，可以寻求法律援助或向相关部门投诉。
   • 对于国企而言，在留置员工时应遵循相关法律法规和内部管理规定，确保留置的合法性和合理性。同时，应尽快完成调查并作出处理决定，以避免不必要的法律纠纷和负面影响。

进一步思考：在处理此类问题时，国企和员工都应充分了解相关法律法规和内部管理规定，以确保各自的权益得到保障。如果对此类问题存在疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。