结论：工亡一次性补助金中，若工亡的母亲在分配协商过程中去世，其应得份额原则上应作为其遗产，按照《中华人民共和国民法典》中关于继承的相关规定进行处理。

详细分析：

1. 工亡一次性补助金的性质：

   • 工亡一次性补助金是职工因工死亡后，其直系亲属按照法律规定从工伤保险基金领取的丧葬补助金、供养亲属抚恤金和因工死亡补助金中的一部分。这笔钱是对工亡职工直系亲属的经济补偿和精神抚慰。

2. 母亲去世后的份额处理：

   • 若工亡的母亲在分配协商过程中去世，其原本应得的工亡一次性补助金份额，将不再属于其个人所有，而是转化为其遗产。
   • 根据《中华人民共和国民法典》中关于继承的规定，遗产应由其合法继承人继承。继承开始后，按照法定继承办理；有遗嘱的，按照遗嘱继承或者遗赠办理；有遗赠扶养协议的，按照协议办理。

3. 继承人的确定：

   • 母亲的继承人通常包括其配偶、子女、父母等第一顺序继承人。若母亲有遗嘱或遗赠扶养协议，则按照遗嘱或协议确定继承人。
   • 在没有遗嘱或遗赠扶养协议的情况下，母亲的子女（包括工亡职工本人，若其仍在世且为母亲的第一顺序继承人之一）和其他第一顺序继承人将共同继承其遗产，即原本应得的工亡一次性补助金份额。

4. 实际操作建议：

   • 在处理此类情况时，建议工亡职工的直系亲属首先协商确定母亲的继承人范围，并明确各自应继承的份额。
   • 若协商不成，可以寻求法律途径解决，如通过调解、仲裁或诉讼等方式确定继承人和继承份额。
   • 在整个过程中，应保留好相关证据，如工亡证明、母亲去世证明、亲属关系证明等，以便在需要时提供证明。

特殊情况说明：

• 若工亡职工的母亲在去世前已经明确表示放弃其应得的工亡一次性补助金份额，或者通过遗嘱等方式将该份额赠与他人，则应按照其意愿进行处理。
• 若工亡职工的母亲在去世时存在未了结的债务，其遗产（包括原本应得的工亡一次性补助金份额）应先用于清偿债务，剩余部分再由继承人继承。

后续行动建议：

• 鉴于此类情况涉及复杂的法律关系和财产分配问题，建议工亡职工的直系亲属在处理过程中咨询专业律师的意见，以确保合法权益得到保障。
• 若在处理过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律建议和解决方案。