三轮车非法载客营运的处罚标准因地区差异和具体情况而有所不同，但主要依据《中华人民共和国道路运输条例》及相关法律法规进行裁定。以下是关于三轮车非法载客营运处罚的详细解答：
一、主要处罚措施
扣留车辆并处罚款
- 首次查获时，执法部门通常会扣留车辆，并处以不低于一定金额（如500元）的罚款。具体金额可能根据地区政策有所调整。
- 若再次查获，除了扣留车辆外，还会加重罚款，并可能对驾驶员进行记分处罚，如再处罚款并记12分。
没收违法所得并处罚款
- 对于有违法所得的非法营运行为，交通运输主管部门会责令停止经营，没收违法所得，并根据违法所得的金额处以罚款。罚款金额通常为违法所得的2倍以上10倍以下。
- 若没有违法所得或违法所得不足一定金额（如2万元），则直接处以一定范围内的罚款（如3万元以上10万元以下）。
刑事责任
- 如果非法营运行为情节严重，构成犯罪的，将依法追究刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，可能面临五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金。
二、其他可能的处罚或措施
暂扣或吊销相关证件
- 在非法营运情节严重的情况下，相关部门有权暂扣或吊销驾驶员的驾驶证等证件。
没收非法营运车辆
- 在某些地区，如果三轮车非法营运行为严重，执法部门有权没收非法营运的三轮车。
交通违法行为的额外处罚
- 如果驾驶三轮车非法营运的同时存在其他交通违法行为，如闯红灯、逆行、超载等，将依据相关法律法规进行额外处罚。
三、从轻或减轻处罚的情况
- 若当事人积极配合调查处理，主动消除或者减轻违法行为危害后果，并且此前没有多次非法营运的记录，交通运输部门可能会根据具体情况从轻或减轻处罚。
四、法律依据与核心条款
- 《中华人民共和国道路运输条例》第六十三条规定了未取得道路运输经营许可擅自从事道路客运经营的处罚措施。
- 地方性法规也可能对三轮车非法营运的处罚做出具体规定，如《北京市查处非法客运若干规定》等。
五、合规建议
- 对于三轮车驾驶员来说，应严格遵守相关法律法规，不要从事非法营运活动。如需从事客运经营，应通过正规渠道申请相关资质。
- 乘客也应选择合法合规的交通工具出行，以保障自身权益和安全。如果发现三轮车非法营运行为，可以向交通部门举报。
综上所述，三轮车非法载客营运将面临严厉的处罚措施，包括扣留车辆、罚款、没收违法所得、刑事责任等。因此，建议三轮车驾驶员和乘客都应遵守相关法律法规，选择合法合规的出行方式。