员工赔偿公司损失一般不能执行配偶财产。下面我将从法律角度详细解释这一结论：

1. 财产独立性原则：

   • 在法律上，夫妻双方的财产原则上是独立的，除非有特别约定或法律规定，否则一方的债务不会自动延及另一方。
   • 员工对公司的赔偿责任，通常属于其个人债务，与配偶无关。

2. 共同债务的情况：

   • 如果员工与配偶共同参与了导致公司损失的行为，或者双方有共同举债的合意，并且该债务用于夫妻共同生活或共同生产经营，那么这种情况下，配偶可能需要承担连带责任。
   • 但这种情况较为特殊，需要具体证据来支持。

3. 执行程序的限制：

   • 在执行程序中，法院通常会严格遵循财产独立性原则，不会随意执行债务人的配偶财产。
   • 如果公司认为配偶的财产与债务人的债务有关，需要提供充分的证据，并通过法律程序来追索。

4. 法律建议：

   • 对于公司而言，在要求员工赔偿损失时，应明确债务的性质和范围，避免涉及无辜的配偶。
   • 如果确实存在共同债务的情况，建议通过法律途径解决，并提供充分的证据来支持自己的主张。

综上所述，员工赔偿公司损失一般不能执行配偶财产，除非存在特殊情况或法律另有规定。如果你在这方面有进一步的法律问题或需要更详细的解释，可以直接向我咨询。