针对您提出的“公司车违法怎么处理”的问题，这通常取决于具体的违法类型和当地的法律法规。不过，我可以根据一般情况和您提供的参考信息，给出一个大致的处理流程和建议。

一、确认违法事实

首先，需要确认公司车辆的具体违法事实，比如是超速、超载、擅自改装、违法停车还是其他类型的违法行为。这通常可以通过交通管理部门的处罚决定书或相关通知来得知。

二、了解处罚依据和内容

根据您提供的参考信息，不同的违法行为会有不同的处罚依据和内容。例如：

• 擅自改装已取得车辆营运证的货运车辆：依据《中华人民共和国道路运输条例》的相关规定，可能会被处以罚款，并责令改正。
• 违法超限运输：依据《超限运输车辆行驶公路管理规定》和《浙江省公路条例》的相关规定，同样可能会被处以罚款。

因此，在处理公司车辆违法时，需要仔细阅读处罚决定书，了解具体的处罚依据和内容。

三、处理流程

1. 接受处罚：

   • 根据处罚决定书的要求，在规定期限内缴纳罚款。罚款可以通过指定的银行、政务服务网或扫描二维码等方式缴纳。
   • 如果对处罚有异议，可以在规定期限内提出行政复议或行政诉讼。

2. 整改措施：

   • 根据处罚决定书的要求，采取相应的整改措施。例如，如果是擅自改装车辆，需要恢复车辆原状；如果是超限运输，需要调整运输方案，确保符合规定。

3. 加强管理：

   • 公司应加强对车辆和驾驶员的管理，确保遵守交通法规，避免类似违法行为再次发生。
   • 可以定期组织驾驶员进行交通安全培训，提高驾驶员的交通安全意识。

四、注意事项

• 及时处理：务必在规定期限内处理违法事项，避免逾期产生额外的加处罚款或影响公司信誉。
• 保留证据：妥善保管处罚决定书、缴费凭证等相关证据，以备后续需要。
• 咨询专业意见：如果对处罚有异议或不清楚如何处理，可以咨询专业的法律人士或交通管理部门。

五、具体案例参考

以您提供的参考信息为例：

• 金华市昱鑫物流有限公司因擅自改装已取得车辆营运证的货运车辆被罚款5000元，并责令改正。该公司需要在规定期限内缴纳罚款，并恢复车辆原状。
• 金华市昱博运输有限公司因违法超限运输被罚款16270元。该公司同样需要在规定期限内缴纳罚款，并调整运输方案以确保符合规定。

综上所述，处理公司车辆违法需要确认违法事实、了解处罚依据和内容、按照处理流程进行整改和接受处罚，并加强后续管理以避免类似事件再次发生。希望这些建议能对您有所帮助。如果您有其他具体问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。