针对“军人有了小三怎么处理”这一问题，这确实是一个涉及军队纪律、法律法规以及道德伦理的复杂议题。以下是我为您提供的详细分析：

一、军队纪律层面的处理

1. 依据：军人作为国家的特殊群体，必须严格遵守《中国人民解放军纪律条令》等军队法规。这些法规明确规定了军人的行为准则和道德规范，包括必须遵守社会公德和家庭美德，不得有违背公序良俗的行为。

2. 处分措施：对于军人与“小三”保持不正当关系的行为，军队将视情节轻重给予相应的纪律处分。这些处分可能包括警告、记过、降职（级）、撤职等，旨在维护军队的纪律性和纯洁性，确保军人能够以身作则，树立良好的形象。若行为涉及不正当经济往来或利用职务之便，处分将更为严厉，甚至可能被开除军籍。

3. 单位内部处理：除了纪律处分外，部队通常还会进行思想教育和整顿，要求涉事军人认识错误并改正。同时，为避免不良影响扩大，可能会调整涉事军人的岗位或进行其他内部处理。

二、法律法规层面的处理

1. 婚姻法层面：

   • 离婚与损害赔偿：根据《中华人民共和国民法典》，军人出轨属于可以离婚的情形。配偶有权提出离婚，并要求出轨方进行损害赔偿。在离婚共同财产的分割上，法院可能会少分或者不分财产给出轨的一方，以体现对过错方的惩罚。
   • 法律后果：出轨行为违背了婚姻关系中互相忠实、互相尊重的原则，无过错方在离婚时有权请求损害赔偿，以维护自身合法权益。

2. 刑法层面：

   • 重婚罪：如果军人构成重婚，即与“小三”以夫妻名义共同生活或明知他人有配偶而与之结婚，将触犯《中华人民共和国刑法》中的重婚罪，面临二年以下有期徒刑或者拘役的刑事处罚。
   • 破坏军婚罪：对于“小三”而言，如果明知是现役军人的配偶而与之同居或者结婚，可能触犯破坏军婚罪，处三年以下有期徒刑或者拘役。这是对军婚特殊保护的一种体现。
   • 其他犯罪：如果军人与“小三”的关系涉及到贪污、受贿、滥用职权等其他违法犯罪行为，将依据相关法律进行处理，如受贿罪等，会受到相应的刑事处罚。

三、综合建议

1. 加强纪律教育：军队应加强对军人的纪律教育，提高军人的法律意识和道德观念，引导军人树立正确的价值观和婚姻观。

2. 完善监督机制：军队应建立健全监督机制，及时发现并处理军人出轨等违纪违法行为，确保军队的纪律性和纯洁性。

3. 依法依规处理：在处理军人出轨问题时，应依法依规进行，确保公正、公平、公开。既要维护军队的纪律性，也要保护军人的合法权益。

4. 鼓励改正错误：对于涉事军人，应鼓励其积极改正错误，修复家庭关系，重新赢得组织和群众的信任。同时，也可以提供必要的心理辅导和帮助，促进其身心健康和全面发展。

总之，军人出轨行为不仅违反了军队纪律和道德规范，还可能触及婚姻法和刑法的相关规定。因此，应依法依规进行严肃处理，以维护军队的纪律性、纯洁性和良好形象。