针对您提出的大件运输车辆未办理超限运输证将如何处罚的问题，以下是我根据相关法律法规为您提供的详细解答：

一、未办理超限运输证的处罚概述

大件运输车辆若未办理超限运输证擅自进行运输，将面临严格的法律处罚。这些处罚措施旨在维护公路设施的安全和道路运输的合法性，确保所有运输活动都在法律框架内进行。

二、具体处罚措施

1. 责令停止违法行为：

   • 公路管理机构或县级以上道路运输管理机构有权责令当事人立即停止超限运输的违法行为。这是为了防止违法行为继续造成损害，并确保公路设施的安全。

2. 罚款：

   • 罚款金额根据超限程度的不同而有所差异。具体来说：
     • 车货总高度、宽度、长度未超过一定标准的，可处200元以下罚款；
     • 超过一定标准但未特别严重的，处200元以上1000元以下罚款；
     • 超限情况较为严重的，处1000元以上3000元以下罚款；
     • 若车货总质量超标，还将根据超重量进行额外罚款，最高不超过3万元。
   • 若存在违法所得，相关部门将没收违法所得，并处以违法所得2倍以上10倍以下的罚款；若无违法所得或不足2万元，将处以3万元以上10万元以下的罚款。

3. 扣留车辆：

   • 公安机关交通管理部门有权依法扣留涉案车辆，直至车主或驾驶员提供有效的超限运输许可证或消除超限状态。这是为了确保违法车辆不再继续上路，造成更大的安全隐患。

4. 其他行政处罚：

   • 根据具体情况，还可能面临警告、吊销驾驶证等其他行政处罚措施。这些措施旨在进一步惩戒违法行为，并防止类似行为再次发生。

5. 追究刑事责任：

   • 如果未办理超限运输证的行为构成犯罪，如造成严重后果或屡教不改，将依法追究刑事责任。这可能涉及刑事拘留、有期徒刑等更严重的法律后果。

三、地区差异与裁量权

在实际执法过程中，各地可能会根据本地实际情况，在上述法律法规规定的框架内，制定更细化的裁量标准。例如，考虑违法情节的轻重、是否初次违法等因素，在罚款幅度内进行合理裁量。因此，具体处罚措施可能因地区而异。

四、法律建议

鉴于大件运输涉及复杂的法律规定和可能的严厉处罚，我建议您在进行大件运输前务必取得相应的运输许可，并严格遵守相关法律法规的规定。同时，对于可能存在的地区差异和裁量权，我建议您咨询当地的交通管理部门或专业律师以获取最准确的信息和法律指导。

综上所述，大件运输车辆未办理超限运输证将面临严厉的法律处罚。为了确保您的运输活动合法合规，并避免不必要的法律风险和经济损失，请务必在运输前办理好相关手续。