结论：在房贷逾期被起诉且已还清逾期房款的情况下，诉讼费和保全费的计算及承担需根据具体情况来确定，以下为你详细分析。
一、诉讼费的计算与承担
诉讼费的计算：
- 诉讼费通常根据案件的性质、标的额大小以及法院所在地的经济发展水平等因素来确定。在房贷逾期案件中，诉讼费一般包括案件受理费和其他诉讼费用（如鉴定费、翻译费等，但此类费用在房贷逾期案件中较为少见）。
- 案件受理费的计算通常依据《诉讼费用交纳办法》的相关规定，根据案件标的额（即逾期房款及可能产生的利息、违约金等总额）按比例分段累计交纳。具体比例可参照当地法院的收费标准，不同地区的标准可能略有差异。
诉讼费的承担：
- 在一般情况下，如果借款人（即被告）在诉讼过程中或诉讼前已经还清了逾期房款，且原告（即银行或贷款机构）同意撤诉或法院判决被告无需承担其他违约责任，那么诉讼费可能由原告承担或双方协商分担。
- 如果法院判决被告（借款人）需承担部分或全部诉讼费，那么被告需按照判决结果支付相应费用。这通常发生在被告被认定存在违约行为且需承担相应法律责任的情况下。
二、保全费的计算与承担
保全费的计算：
- 保全费是指法院在采取保全措施（如查封、扣押、冻结等）时所产生的费用。保全费的计算通常依据《诉讼费用交纳办法》的相关规定，根据保全财产的数额或价值按比例交纳。
- 保全费的具体数额取决于保全财产的种类、数量以及价值等因素。在房贷逾期案件中，如果银行或贷款机构申请了财产保全（如查封借款人的房产），那么保全费将根据房产的价值来计算。
保全费的承担：
- 保全费的承担原则与诉讼费类似，通常由申请保全的一方（即原告）先行垫付。如果保全措施最终被法院确认有效且被告被认定存在违约行为，那么保全费可能由被告承担。
- 如果保全措施被法院撤销或确认无效，或者被告在诉讼过程中或诉讼前已经还清了逾期房款且无需承担其他违约责任，那么保全费可能由原告承担或双方协商分担。
三、特殊情况下的费用承担
- 双方协商：在房贷逾期案件中，如果双方能够达成和解协议或调解协议，那么诉讼费和保全费的承担可以由双方自行协商确定。
- 法院判决：如果案件进入诉讼程序并经过法院审理，那么诉讼费和保全费的承担将由法院根据案件事实和法律规定作出判决。
四、建议与注意事项
- 及时沟通：在房贷逾期被起诉后，借款人应尽快与银行或贷款机构沟通，尝试达成和解或调解协议，以避免不必要的诉讼费用和保全费用。
- 保留证据：借款人应保留好与房贷相关的所有证据（如还款记录、合同等），以便在诉讼过程中证明自己的还款情况或抗辩理由。
- 咨询专业律师：虽然我已经为你提供了基本的法律分析和建议，但每个案件的具体情况都有所不同。如果你对诉讼费和保全费的计算或承担有疑问，或者需要更具体的法律帮助，可以直接向我咨询。
希望以上分析能对你有所帮助。如果你还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我提问。