申请司法鉴定费用通常不是在立案时收取，而是根据具体鉴定程序和阶段来收取。以下是详细说明：

1. 立案阶段与司法鉴定费用的关系
   立案是司法机关（如法院、检察院）对案件进行审查并决定是否启动诉讼程序的行为。在此阶段，司法机关主要审查案件是否符合立案条件（如是否有明确的被告、诉讼请求是否合法等），一般不会直接涉及司法鉴定费用的收取。司法鉴定费用通常与后续的鉴定程序相关，而非立案程序。

2. 司法鉴定费用的收取时机
   司法鉴定费用通常在以下阶段收取：

   • 鉴定申请阶段：当事人向司法机关或鉴定机构提出鉴定申请时，可能需要预缴部分或全部鉴定费用。具体金额和缴纳方式由鉴定机构根据相关规定确定。
     
   • 鉴定实施阶段：鉴定机构在完成鉴定工作后，会根据实际发生的费用（如实验费、专家咨询费等）向当事人出具收费通知，当事人需在规定时间内缴纳。
     
   • 诉讼阶段：如果鉴定费用作为诉讼费用的一部分，法院可能会在判决中明确由哪一方承担，并在执行阶段进行结算。

3. 费用承担原则
   根据《诉讼费用交纳办法》等相关规定，司法鉴定费用的承担通常遵循以下原则：

   • 谁主张、谁负担：一般情况下，提出鉴定申请的一方需先行垫付鉴定费用。
     
   • 最终由法院判决确定：法院会根据案件具体情况（如鉴定结果对案件的影响、双方过错程度等）判决鉴定费用由哪一方承担，或由双方分担。

4. 特殊情况说明

   • 经济困难当事人：如果当事人经济困难，可以向法院申请缓交、减交或免交鉴定费用，但需提供相关证明材料。
     
   • 鉴定机构收费标准：鉴定费用需按照物价部门核定的标准收取，不得随意加价。当事人对费用有异议的，可以向鉴定机构或相关部门投诉。

温馨提示：
如果您在申请司法鉴定过程中遇到费用问题（如收费不合理、拒不缴纳等），可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。