在法院起诉离婚时，分居时间的计算需以“因感情不和”为前提，且需满足连续分居满两年的法定条件，具体计算方式及要点如下：

1. 分居时间的起算点
   分居时间应从夫妻双方因感情不和开始分居的日期起算，而非因工作、学习、就医等客观原因导致的暂时分离。例如：

   • 若因一方出轨导致感情破裂，自出轨方搬离共同住所之日起算；
     
   • 若因长期争吵后分房居住，需证明双方无共同生活、无经济往来、无性关系等实质分居状态。
     法律依据：《民法典》第1079条明确，分居需以“感情不和”为原因，单纯物理分离不构成法律意义上的分居。

2. 分居时间的连续性要求
   分居状态必须连续满两年，中间不得有间断。若期间双方短暂同居或恢复共同生活，则需重新计算分居时间。例如：

   • 分居1年后因孩子问题短暂同居1个月，后再次分居，则需从第二次分居之日起重新计算两年；
     
   • 若分居期间一方多次试图挽回婚姻（如搬回共同住所），但另一方拒绝，需结合证据判断是否中断分居状态。
     实践要点：需通过租房合同、水电费记录、证人证言等证据证明分居的连续性。

3. 分居时间的证明方式
   法院认定分居时间需结合客观证据，而非单方陈述。常见证据包括：

   • 居住证明：如租房合同、物业缴费记录、居委会证明等；
     通讯记录：如分居期间双方无联系的短信、邮件、聊天记录；
     证人证言：如邻居、亲友证实双方未共同生活；
     其他证据：如分居协议（若有）、一方单独就医记录等。
     风险提示：若证据不足（如仅口头主张分居），法院可能不予采信。

4. 特殊情形下的分居时间认定

   • 一方被宣告失踪：若一方下落不明满两年，另一方可直接起诉离婚，无需等待分居两年；
     
   • 家庭暴力导致分居：若因家暴分居，可同时主张离婚损害赔偿，分居时间仍需满足两年（但家暴本身可作为感情破裂的直接证据）；
     
   • 协议分居：若双方签订书面分居协议，需明确分居原因及期限，可作为辅助证据。
     

总结建议：若计划以分居满两年为由起诉离婚，需提前收集分居证据，并确保分居状态连续、原因明确。如有疑问，可直接向我咨询具体证据准备及诉讼策略。