核心结论：非法所得即使缴纳了税款，依然不能改变其非法性质，需承担相应法律责任，但缴纳税款的情况可能会在量刑或处罚时作为一定考量因素。以下是具体分析：
- 非法所得的性质认定
- 非法所得是指违反法律法规规定，通过不正当手段获得的收入或财产。其本质的违法性不因后续是否缴纳税款而改变。例如，通过盗窃、诈骗、贪污等违法犯罪行为获取的财物，即便行为人主动向税务机关申报并缴纳了相关税款，这些财物仍然属于非法所得。因为缴纳税款是公民和企业基于合法收入应履行的法定义务，而非法所得本身就不具备合法来源，不能因为履行了部分合法义务就使其合法化。
- 法律责任方面
- 刑事责任：对于构成犯罪的非法所得行为，如诈骗罪、贪污罪等，行为人除了要退赔非法所得外，还需承担相应的刑事处罚，如有期徒刑、罚金等。缴纳税款并不能免除刑事责任，但在量刑时，法院可能会将缴纳税款这一情节作为酌定从轻处罚的考量因素之一。例如，在诈骗犯罪中，如果犯罪嫌疑人诈骗所得后主动缴纳了部分税款，法院在量刑时可能会根据其认罪态度、社会危害程度等因素，在法定刑幅度内适当从轻处罚，但这并不意味着可以免除刑事处罚。
- 行政责任：对于一些情节较轻、尚未构成犯罪的非法所得行为，行政机关会依法作出行政处罚，如没收非法所得、罚款等。同样，缴纳税款不能成为免除行政处罚的理由，但行政机关在作出处罚决定时，也可能会综合考虑缴纳税款的情况，在处罚幅度上适当调整。比如，对于违反市场管理秩序获取非法利益的经营者，如果其主动缴纳了相关税款，市场监管部门在没收非法所得和罚款时，可能会根据具体情况从轻处理。
- 税务处理方面
- 税务机关在发现纳税人存在非法所得并已缴纳税款的情况时，会按照相关税收法律法规进行处理。一方面，对于非法所得部分对应的税款，如果纳税人是通过虚假申报等手段缴纳的，税务机关会进行税务稽查，追缴其少缴或骗取的税款，并加收滞纳金和处以罚款。另一方面，如果纳税人在获取非法所得后，确实按照规定申报并缴纳了税款，税务机关会将该部分税款作为已缴税款进行记录，但在后续的法律程序中，不影响对非法所得的认定和处理。
建议：如果涉及非法所得相关问题，应尽快主动向相关部门说明情况，积极配合调查，争取从轻处理。若你还有其他关于此类法律问题的疑问，欢迎继续向我咨询。