基本农田里的水坑能否回填，需视具体情况而定，但一般情况下，未经批准擅自回填基本农田里的水坑是违法的。以下从不同角度为你详细分析：
一、基本农田的保护原则
基本农田是按照一定时期人口和社会经济发展对农产品的需求，依据土地利用总体规划确定的不得占用的耕地。根据《中华人民共和国土地管理法》和《基本农田保护条例》的相关规定，基本农田受到严格保护，任何单位和个人不得擅自改变其用途或进行破坏。
二、水坑回填的合法性分析
若水坑是自然形成的：
- 自然形成的水坑，如果未对基本农田造成破坏，且回填行为不会改变基本农田的用途或导致土地质量下降，理论上回填行为可能不构成违法。但即便如此，也建议事先咨询当地土地管理部门或农业部门，了解是否需要办理相关手续或获得批准。
若水坑是人为挖掘的：
- 人为挖掘的水坑，如果未经批准，且改变了基本农田的原状或用途，那么回填行为本身可能就涉及违法。因为挖掘行为本身可能已经违反了基本农田保护的规定，回填只是试图纠正这一违法行为，但并不能免除之前的违法责任。
- 即使回填行为是为了恢复土地原状，也需要获得相关部门的批准，并按照规定的程序进行。
回填行为可能涉及的后果：
- 未经批准擅自回填基本农田里的水坑，可能面临土地管理部门的处罚，包括罚款、责令恢复原状等。
- 如果回填行为导致基本农田质量下降或无法恢复，还可能承担更严重的法律责任，如刑事责任。
三、建议与注意事项
事先咨询：
- 在进行任何回填行为之前，建议事先咨询当地土地管理部门或农业部门，了解相关法律法规和政策要求。
办理手续：
- 如果回填行为需要获得批准，应按照规定的程序办理相关手续，确保行为的合法性。
保护土地质量：
- 在回填过程中，应注意保护土地质量，避免使用有害物质或造成土地污染。
遵守规定：
- 严格遵守基本农田保护的相关规定，不擅自改变基本农田的用途或进行破坏。
总结来说，基本农田里的水坑能否回填并非一个简单的是非问题，而是需要根据具体情况进行判断。为了确保行为的合法性并避免不必要的法律风险，建议在进行回填行为之前咨询专业律师或当地土地管理部门，了解相关法律法规和政策要求。如果你有进一步的法律问题或需要更具体的建议，可以直接向我咨询。