若在打官司过程中发现对方转移公司财产，可采取以下法律措施来维护自身权益：

1. 立即申请财产保全
   在诉讼过程中，若发现对方有转移、隐匿、变卖公司财产等可能损害你权益的行为，可第一时间向法院申请财产保全。法院会根据情况裁定冻结、查封或扣押对方的相关财产，防止财产进一步流失。申请财产保全时，需提供初步证据证明对方存在转移财产的行为或风险，并可能需要提供担保。

2. 收集并固定证据
   转移公司财产的行为往往较为隐蔽，因此需积极收集相关证据，如银行转账记录、合同、发票、聊天记录等，以证明对方存在恶意转移财产的行为。证据的收集应合法、有效，并尽可能全面，以便在后续诉讼中支持你的主张。

3. 向法院提起撤销权之诉
   若对方通过无偿转让、以明显不合理的低价转让财产等方式损害你的权益，可在知道或应当知道撤销事由之日起一年内，向法院提起撤销权之诉，请求法院撤销对方的转让行为，并恢复原状或赔偿损失。

4. 追究对方刑事责任（如构成犯罪）
   若对方转移财产的行为涉嫌犯罪，如职务侵占罪、挪用资金罪等，可向公安机关报案，追究对方的刑事责任。刑事责任的追究不仅可对对方形成震慑，还可为后续的民事赔偿提供有力支持。

5. 在执行阶段申请强制执行与参与分配
   若已获得生效判决但对方仍不履行义务，且发现对方有转移财产的行为，可在执行阶段向法院申请强制执行，并要求法院对对方的财产进行全面调查。若对方财产不足以清偿所有债务，还可申请参与分配，按比例受偿。

若你是公司股东或利益相关方，发现公司管理层或控股股东在打官司期间转移公司财产，还可采取以下措施：

1. 以公司名义提起损害公司利益责任纠纷之诉
   若转移财产的行为损害了公司利益，且你作为股东能够证明公司管理层或控股股东存在滥用职权、损害公司利益的行为，可以公司名义提起损害公司利益责任纠纷之诉，要求对方赔偿公司损失。

2. 行使股东知情权，调查公司财务状况
   作为股东，你有权查阅公司章程、股东会会议记录、董事会会议决议、财务会计报告等文件，了解公司财务状况。若发现异常，可进一步要求公司或相关责任人解释说明，并采取相应措施。

温馨提示：在处理此类问题时，建议保持冷静，及时咨询并委托专业律师协助处理。律师可根据具体情况为你制定合适的诉讼策略，并帮助你收集证据、申请财产保全、提起诉讼等，以最大限度维护你的合法权益。