合同专用章和有编码的章并不完全一样，但合同专用章可以带有编码，且编码的存在与否并不影响其法律效力。以下是对这一问题的详细分析：
一、合同专用章与编码的关系
合同专用章的编码情况：
- 合同专用章并非强制要求必须带有编码。在过去，许多企业的合同专用章并没有编码标识。然而，随着印章管理的日益规范化和信息化，越来越多的地区开始推行带有编码的印章制度。
- 编码的作用类似于印章的“身份证”，通过它可以查询印章的相关备案信息，如刻制单位、备案时间等，有助于公安机关等管理部门对印章的刻制、使用等情况进行监管和追溯。
编码的普遍性与特殊性：
- 并非所有合同专用章都有编码。一些较早时期刻制的合同专用章或没有通过公安机关审批的合同专用章可能就没有编码。
- 但对于新刻制或经过公安机关备案的合同专用章，通常都会赋予编码，以增强其安全性和防伪性。
二、合同专用章的法律效力
法律效力与编码无关：
- 合同的法律效力并不取决于合同专用章是否带有编码。只要该合同章是单位的合法印章，且合同双方当事人都具备相应的民事行为能力，意思表示真实，并且合同的内容符合法律规定，那么所签订的合同就是有效的。
- 在实践中，无论合同专用章是否带有编码，都不会影响其对合同法律效力的确认。关键在于验证印章的真实性以及合同内容的合法性。
编码的辅助作用：
- 虽然编码不是合同专用章法律效力的决定因素，但它可以作为识别印章真伪和合法性的重要依据之一。在商业活动中，交易双方可以通过向公安机关查询编码的方式，核实合同专用章的真伪和合法性。
三、实际应用中的建议
单位选择：
- 单位在选择是否给合同专用章加编码时，应考虑自身的实际情况和所在地区的具体规定。如果单位仅有一个合同专用章，且不存在需要区分盖章人的情况，那么该章可以不带有编号。
- 如果单位希望增强印章的安全性和防伪性，或者便于在需要时进行查询和验证，那么可以选择给合同专用章加编码。
签订合同时的注意事项：
- 在签订合同时，除了核对合同专用章的编码信息外，还应结合其他因素进行综合判断，如印章的字体、颜色、形状等特征，以及合同的签署人身份、签署时间等信息。
- 如有任何疑虑，建议进一步咨询以确认印章的真实性和合法性，避免在商业活动中遭受不必要的损失。
总结：合同专用章和有编码的章并不完全一样，但合同专用章可以带有编码。编码的存在与否并不影响合同专用章的法律效力，关键在于印章的合法性和合同内容的合法性。在签订合同时，应仔细核对合同专用章的相关信息，并结合其他因素进行综合判断。如有任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询。