事业编三年服务期内辞职确实会受到一定影响，这些影响主要体现在法律责任、人事关系处理以及职业发展等方面。以下是对此问题的详细分析：
一、法律责任与违约责任
合同条款的约束：
- 事业编人员与单位签订的聘用合同中，通常会明确约定服务期及违反该约定的违约责任。若在服务期内辞职，可能需按合同规定支付违约金。违约金的数额一般根据服务年限剩余时长、个人工资水平等因素综合确定，但不得超过用人单位提供的培训费用，且不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
法律法规的依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十二条，用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。
- 同时，《事业单位人事管理条例》第十七条也规定，事业单位工作人员提前30日书面通知事业单位，可以解除聘用合同，但双方对解除聘用合同另有约定的除外。这意味着，如果合同中有服务期及违约责任的约定，辞职时需遵守这些约定。
二、人事关系处理受阻
档案转移手续：
- 单位可能因服务期未满拒绝配合办理档案转移手续，这会影响个人后续的就业、深造、考公等。档案是个人职业生涯的重要记录，无法顺利转移可能会带来诸多不便。
其他离职手续：
- 工资结算、社保减员等其他离职手续也可能无法顺利进行。这些手续的办理对于保障个人权益至关重要，因此需谨慎处理。
三、职业发展受限
公职类考试限制：
- 各地对于服务期内辞职的事业编人员参加公职类考试（如事业单位招聘、公务员考试）可能会有一定限制。部分地区明确规定在一定年限内不得报考，这会影响个人的职业发展规划。
人事诚信档案记录：
- 违约行为可能被记录在个人的人事诚信档案中，对未来应聘重要岗位、参与重大项目合作等产生负面影响。在竞争激烈的职场环境中，良好的人事诚信记录是个人职业发展的重要保障。
原单位评先评优、职称评定：
- 原单位在后续评先评优、职称评定等方面可能会考虑其服务期内违约辞职的行为，从而影响其获得相关荣誉和晋升机会。这对于个人的职业发展来说无疑是一个不小的打击。
四、单位内部处理
纪律处分：
- 单位可能根据内部规章制度对在最低服务年限内辞职的人员给予纪律处分，如警告、记过等。这些处分会进入个人人事档案，损害个人形象和职业声誉。
除名处理：
- 未经批准擅自离职或停薪留职期满后未按规定回原单位工作且未办理辞职手续的，可能被视为无故旷工，用人单位有权进行除名处理。这将导致个人失去事业编身份，且可能面临更严重的法律后果。
五、建议与注意事项
充分了解合同条款：
- 在决定辞职前，务必充分了解聘用合同中的服务期及违约责任条款，以便做出明智的决策。
权衡利弊：
- 综合考虑辞职可能带来的法律责任、人事关系处理受阻以及职业发展受限等后果，权衡利弊后再做决定。
遵循正规流程：
- 若确需辞职，应遵循正规流程，提前向单位提交书面辞职申请，并尽量与单位协商解决相关事宜，以减少不必要的纠纷和损失。
保护个人合法权益：
- 在辞职过程中，应注意保护自己的合法权益，如确保工资结算、社保减员等手续的顺利办理，以及避免承担不必要的违约责任等。
总之，事业编三年服务期内辞职是一个需要谨慎考虑的问题。在做出决定前，务必充分了解相关法律法规和合同条款，权衡利弊后再做决策。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。