结论：在房产租赁场景中，租赁合同一式三份的分配通常遵循以下原则：房东持有一份，租客持有一份，第三份可能根据具体情况交给房屋中介机构、见证人或用于其他特定目的（如备案）。具体分配应根据租赁合同的性质、参与方及约定来确定。
详细分析：
房东与租客各持一份：
- 这是租赁合同分配的基本原则。房东作为房屋的所有者或管理者，需要持有一份合同以明确其出租房屋的权利和义务。
- 租客作为房屋的承租人，同样需要持有一份合同以保障其居住和使用房屋的权益。
- 双方各持一份合同，有助于在合同履行过程中随时查阅合同条款，确保自身权益得到保障。
第三份合同的灵活分配：
- 房屋中介机构：如果租赁过程是通过房屋中介机构进行的，那么第三份合同通常留存在中介机构。中介机构作为交易的第三方，持有合同有助于协助处理纠纷、提供咨询和记录存档。
- 见证人：在某些情况下，租赁双方可能希望邀请见证人参与合同签订过程。见证人可以是一方或双方信任的朋友、亲戚或专业人士。第三份合同可以交给见证人保存，作为合同签订的见证。
- 备案用途：根据当地法律法规的要求，租赁合同可能需要提交给相关部门进行备案。在这种情况下，第三份合同可以用于备案目的，以确保租赁交易的合法性和规范性。
不同场景下的合同分配示例：
- 普通房屋租赁：房东、租客各持一份，第三份可能交给中介机构或见证人。
- 涉及政府备案的租赁：如公租房、廉租房等，房东（可能是政府或相关机构）、租客各持一份，第三份提交给相关部门进行备案。
- 商业租赁：在商业租赁场景中，除了房东和租客外，可能还涉及物业管理公司、担保方等。此时，合同分配可能更加复杂，需要根据具体约定来确定每份合同的归属。
法律建议：
- 在签订租赁合同时，双方应明确约定合同的分配方式，并在合同中注明每份合同的持有方。
- 如果租赁过程涉及中介机构或见证人，应确保他们了解并同意合同的分配方式，并在必要时在合同上签字或盖章确认。
- 无论合同如何分配，双方都应妥善保管好自己的合同原件，以备不时之需。
可能后果：
- 如果合同分配不明确或存在争议，可能导致在合同履行过程中出现纠纷时无法及时提供有效的合同证据。
- 如果合同原件丢失或损坏，可能给双方带来不必要的麻烦和损失。因此，妥善保管合同原件至关重要。
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