公交公司扣驾驶员安全奖是否合法，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下是从不同角度进行的分析：
一、合法扣减的情况
合同或规章制度中有明确规定：
- 如果公交公司与驾驶员签订的劳动合同或公司规章制度中明确规定了安全奖的发放条件、扣减情形及标准，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么公交公司按照这些规定扣减安全奖是合法的。
- 例如：合同中规定，若驾驶员在一个月内发生两次以上违规操作，将扣减当月安全奖。若驾驶员确实存在此类情况，公交公司扣减安全奖即属合法。
驾驶员存在严重违规或违法行为：
- 如果驾驶员存在严重违反交通规则、公司规章制度或法律法规的行为，且这些行为直接或间接导致了安全事故或潜在的安全风险，公交公司为了维护公共安全、公司利益及员工纪律，有权扣减或取消驾驶员的安全奖。
- 例如：驾驶员酒后驾车、超速行驶等严重违规行为，公交公司可以依据相关规定扣减其安全奖。
二、不合法扣减的情况
合同或规章制度中无明确规定：
- 如果公交公司与驾驶员签订的劳动合同或公司规章制度中未明确规定安全奖的扣减情形及标准，或者规定不明确、存在歧义，那么公交公司随意扣减安全奖可能构成违法。
- 例如：合同中仅规定“驾驶员需遵守交通规则，否则将影响安全奖发放”，但未明确具体扣减标准或情形，此时公交公司扣减安全奖可能缺乏合法依据。
扣减行为缺乏合理性或公正性：
- 即使合同或规章制度中有相关规定，但如果公交公司的扣减行为缺乏合理性或公正性，如扣减标准过高、扣减程序不透明、存在歧视性扣减等，也可能构成违法。
- 例如：公交公司以“驾驶员未参加公司组织的培训”为由扣减安全奖，但该培训并非驾驶员必须参加的，且未提前告知驾驶员不参加将扣减安全奖，此时扣减行为可能缺乏合理性。
违反法律法规的强制性规定：
- 如果公交公司的扣减行为违反了法律法规的强制性规定，如最低工资标准、劳动保护规定等，那么该扣减行为必然违法。
- 例如：公交公司扣减安全奖后，驾驶员的实际工资低于当地最低工资标准，此时扣减行为即属违法。
三、建议与措施
驾驶员应仔细审查劳动合同及公司规章制度：
- 驾驶员在入职时应仔细审查劳动合同及公司规章制度中关于安全奖的规定，确保自己了解并同意相关条款。
保留相关证据：
- 如驾驶员认为公交公司的扣减行为违法，应保留相关证据，如工资条、扣减通知、合同条款等，以便在争议发生时维护自己的合法权益。
寻求法律帮助：
- 若驾驶员与公交公司就安全奖的扣减问题发生争议，且无法协商解决，可以向我咨询或寻求其他法律帮助，通过法律途径维护自己的权益。
总之，公交公司扣驾驶员安全奖是否合法，需根据具体情况来判断。驾驶员应了解自己的权益和义务，并在必要时寻求法律帮助以维护自己的合法权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。