违法分包的处罚机关主要依据工程类型和监管职责来确定，具体如下：
建筑工程领域：
- 处罚机关：县级以上人民政府住房城乡建设主管部门是建筑工程领域违法分包行为的主要处罚机关。
- 法律依据：根据《中华人民共和国建筑法》第六十七条及《建设工程质量管理条例》第六十二条，对于违法分包行为，住房城乡建设主管部门可责令改正，没收违法所得，并处以罚款；情节严重的，还可责令停业整顿，降低资质等级，甚至吊销资质证书。
- 具体情形：包括但不限于将工程分包给个人、分包给不具备相应资质的单位、施工总承包单位将工程主体结构分包（钢结构工程除外）、专业分包单位再分包非劳务作业部分等。
交通运输工程领域：
- 处罚机关：交通运输主管部门负责公路、水运等交通建设工程中的违法分包行为监管和处罚。
- 法律依据：根据《公路建设市场管理办法》等相关规定，违法分包行为将面临罚款，情节严重者还将被限制进入公路建设市场。
水利工程领域：
- 处罚机关：县级以上人民政府水行政主管部门是水利工程领域违法分包行为的主要处罚机关。
- 法律依据：依据《水利建设市场主体信用信息管理办法》等相关规定，违法分包主体将受到信用惩戒等处理，并可能面临罚款、责令整改等具体行政处罚。
特殊专业工程领域：
- 处罚机关：如电力工程等特殊专业工程，由相应的专业监管机构（如电力监管机构）依照相关电力法规进行查处。
处罚流程与法律责任：
处罚流程：一般包括调查取证、审查处理、告知权利、组织听证（如符合听证规定）、送达决定等步骤。建设行政主管部门在发现或接到举报后，会依法进行调查取证，并根据违法事实和证据进行审查处理。
法律责任：违法分包者不仅可能面临行政处罚，如罚款、责令停业整顿、降低资质等级及吊销资质证书等，还可能承担民事责任乃至刑事责任。例如，因违法分包导致工程质量不合格而造成损失的，承包单位与分包单位应承担连带赔偿责任；若因违法分包发生重大责任事故，相关主体还可能依法承担刑事责任。
建议与总结：
违法分包行为严重扰乱建筑市场秩序，危及工程质量与安全。各建筑单位应严格遵守相关法律法规，加强内部管理，避免违法分包行为的发生。同时，监管部门也应加大执法力度，对违法分包行为进行严厉打击，以维护建筑市场的健康发展。如果您在建设工程领域遇到任何法律问题，包括违法分包的处罚与应对等，都可以直接向我咨询，我将为您提供专业的法律意见和帮助。