传真签字的协议在符合一定条件下是有效的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律效力基础
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人订立合同可以采用书面形式、口头形式或者其他形式。书面形式明确包括了传真等可以有形地表现所载内容的形式。因此，通过传真签订的协议，在法律上是被认可的，具有法律效力。
二、有效性条件
要使通过传真签订的协议有效，需满足以下条件：
- 双方真实意思表示：协议的内容必须是双方当事人真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情形。这是协议有效的基本前提。
- 不违反法律强制性规定：协议的内容不得违反法律法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。例如，协议不能涉及非法活动或损害国家、集体或第三人的利益。
- 具备协议基本要素：协议应包含当事人的名称或者姓名和住所、标的、数量、质量、价款或者报酬、履行期限、地点和方式、违约责任等基本条款。这些条款是协议成立和履行的必要条件。
- 签字确认：虽然在传真件上签字可能无法直接体现原件的某些特性，但如果在传真件上有双方的签字或盖章，且能够证明该签字或盖章是真实的，那么这份传真件就可以被视为具有法律效力的协议文件。
三、存在的风险及应对措施
尽管传真签字的协议在法律上被认可，但在实际应用中仍存在不可忽视的风险：
证明难度与成本：传真件的真实性在发生争议时可能难以证明，因其易于被伪造或篡改。这可能导致当事人需投入更多的时间与资源进行司法鉴定，以确定其真实性。
- 应对措施：在签订协议时，可以要求对方在传真件上加盖公章或签字后回传，并保留好相关证据。同时，可以考虑在传真签订协议后，尽快补签书面的原件协议，以确保协议的权威性和可追溯性。
原件要求问题：在某些正式场合，如行政审批、备案等，相关部门可能要求提供协议的原件。传真件因非原始文件，可能无法满足此类要求，从而影响业务的正常办理。
- 应对措施：对于重要协议，建议在传真签字后尽快通过邮寄或其他可靠方式交换正式书面协议文本，以确保双方权益得到充分保障。
四、建议
为有效降低传真签字协议的风险，建议在条件允许的情况下，采取以下措施：
- 补签书面原件协议：在传真签订协议后，尽快补签书面的原件协议，以确保协议的权威性和可追溯性。
- 采用电子签名：利用可靠的电子签名技术，如数字签名，确保协议的真实性与完整性，同时满足现代商务的高效与安全需求。
综上所述，传真签字的协议在遵循法律规定的前提下具有法律效力，但其固有风险不容忽视。为确保交易的安全与效率，建议结合使用更可靠的签约方式，如书面原件协议或电子签名。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。