如果父亲质疑女儿不是亲生并决定去做亲子鉴定，可能会产生以下几种后果：
鉴定结果确认亲子关系：
- 法律后果：如果鉴定结果显示父亲与女儿确实存在亲子关系，那么父亲的质疑将被证实为不成立。这种情况下，父亲可能需要向女儿及其母亲（如果涉及）道歉，以修复因质疑可能造成的家庭关系裂痕。
- 家庭影响：亲子关系的确认有助于维护家庭和谐，消除不必要的猜疑和误解，促进家庭成员之间的信任和沟通。
鉴定结果否认亲子关系：
- 法律后果：若鉴定结果显示父亲与女儿不存在亲子关系，这将引发一系列法律问题。首先，父亲可能不再承担对女儿的法定抚养义务（除非存在其他法律关系，如继父女关系且形成了抚养教育关系）。其次，如果父亲之前已支付了抚养费，他可能有权要求返还部分或全部费用，具体取决于当地法律和实际情况。此外，这还可能影响到女儿的继承权等法律权益。
- 家庭影响：亲子关系的否认将对家庭关系造成严重冲击，可能导致家庭破裂、亲情疏远等后果。女儿及其母亲可能会面临巨大的心理压力和情感困扰。
鉴定过程中的法律程序与权益保护：
- 自愿鉴定与强制鉴定：亲子鉴定通常需要当事人的自愿参与。如果父亲或女儿（或其法定代理人，如母亲）不同意进行鉴定，法院一般不会强制进行。但在某些特定情况下，如涉及诉讼且法院认为鉴定对案件处理至关重要时，可能会根据相关法律规定进行强制鉴定。
- 隐私保护：在进行亲子鉴定时，应确保当事人的隐私得到保护。鉴定机构应严格遵守相关法律法规，不得泄露鉴定结果或当事人的个人信息。
对女儿心理与情感的影响：
- 心理创伤：无论鉴定结果如何，父亲对女儿亲子关系的质疑都可能对女儿造成心理创伤。这种质疑可能让女儿感到被否定、被怀疑，甚至产生自卑、焦虑等负面情绪。
- 情感支持：在这种情况下，女儿需要得到家庭成员、朋友或专业心理咨询师的支持和关爱，以帮助她度过这段困难时期。
建议：
- 在决定进行亲子鉴定之前，父亲应慎重考虑其可能带来的法律后果和家庭影响。如果可能的话，可以先尝试通过沟通、协商等方式解决疑虑，避免不必要的法律纠纷和家庭矛盾。
- 如果确实需要进行亲子鉴定，应选择正规、有资质的鉴定机构，并确保鉴定过程的合法性和公正性。
- 在鉴定过程中和鉴定结果出来后，都应关注女儿的心理和情感状态，给予她足够的关爱和支持。
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