结论：建设用地使用权纠纷中，是否可以起诉国土资源局，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 被告的确定原则

   • 在建设用地使用权纠纷中，被告的确定通常遵循“谁侵权，谁被告”的原则。即，如果纠纷是由于某个具体主体（如土地储备中心、开发商、其他土地使用者等）的侵权行为引起的，那么该主体应当作为被告。
   • 国土资源局作为土地管理部门，其职责主要是进行土地规划、管理、监督等，并不直接参与土地的具体使用或交易。因此，在一般情况下，国土资源局不是建设用地使用权纠纷的直接被告。

2. 国土资源局可能成为被告的特殊情况

   • 行政不作为或违法行政：如果国土资源局在土地管理过程中存在行政不作为或违法行政行为，且该行为直接导致了建设用地使用权纠纷的发生或加剧，那么国土资源局可能因行政不作为或违法行政而成为被告。例如，国土资源局未依法审批土地使用权转让，导致纠纷产生。
   • 直接参与土地交易或使用：虽然国土资源局通常不直接参与土地的具体使用或交易，但在某些特殊情况下，如国土资源局直接作为土地出让方或受让方参与土地交易，且因该交易引发纠纷，那么国土资源局也可能成为被告。不过，这种情况相对较少见。

3. 起诉国土资源局的法律后果与考量

   • 法律后果：如果国土资源局被错误地列为被告，且法院经审理认为其并非适格被告，那么案件可能会被驳回起诉或判决国土资源局不承担责任。这不仅会浪费当事人的时间和精力，还可能对当事人的权益造成进一步损害。
   • 考量因素：在决定是否起诉国土资源局时，当事人应充分考虑纠纷的具体原因、国土资源局在纠纷中的角色和责任、以及起诉的可行性和必要性等因素。如果国土资源局并非纠纷的直接原因或责任方，那么起诉国土资源局可能并非明智之举。

4. 建议与策略

   • 明确被告：在提起诉讼前，当事人应仔细分析纠纷的原因和责任方，明确适格的被告。如果纠纷是由于土地储备中心或其他主体的侵权行为引起的，那么应将这些主体作为被告。
   • 咨询专业律师：由于建设用地使用权纠纷涉及复杂的法律关系和专业知识，当事人在提起诉讼前应咨询专业律师的意见。律师可以根据当事人的具体情况和纠纷的性质，为当事人提供专业的法律建议和诉讼策略。
   • 收集证据：在提起诉讼前，当事人应充分收集与纠纷相关的证据材料，如土地使用权证书、土地转让合同、行政审批文件等。这些证据材料将有助于证明当事人的主张和权益。

总结：在建设用地使用权纠纷中，是否可以起诉国土资源局需根据具体情况判断。如果国土资源局并非纠纷的直接原因或责任方，那么起诉国土资源局可能并非明智之举。当事人在提起诉讼前应仔细分析纠纷的原因和责任方，明确适格的被告，并咨询专业律师的意见。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。