当您发现自己在家地上种的树被邻居拔了，这确实是一个令人不悦的情况，但别担心，我们可以按照以下步骤来妥善处理这个问题，以维护您的合法权益。

一、明确权益与责任

首先，您需要明确的是，如果邻居没有合理的理由拔除了您种植的树，那么这种行为是侵犯了您的财产权。您有权要求邻居对此进行赔偿，或者通过法律途径来追究其责任。

二、固定证据

在采取任何行动之前，固定证据是至关重要的。您应该立即对现场进行多角度、清晰的拍照和录像，记录被拔树木的数量、大小、受损程度以及周围的环境。这些证据将在后续的维权过程中起到关键作用。同时，如果有目击者，您也应该询问并留下他们的联系方式，以便在需要时作为证人证言。

三、与邻居沟通协商

在固定了证据之后，您可以尝试与邻居进行沟通协商。在沟通过程中，请保持冷静和理性，避免情绪化的冲突。您可以询问邻居拔树的原因，看看是否存在误会或者可以协商解决的空间。如果邻居承认了行为且没有合理的解释，您可以明确提出赔偿要求，包括树木的价值以及因拔树而可能给您带来的其他经济损失。

四、寻求第三方调解

如果与邻居的沟通协商没有取得满意的结果，您可以考虑寻求第三方的调解。您可以向村委会、居委会等基层组织申请调解，他们通常具有地方影响力和调解经验，可能能够帮助您和邻居达成和解。另外，您也可以依法向人民调解委员会申请调解，由专业的调解员根据法律法规和情理来提出解决方案。

五、报警处理（如情况严重）

如果邻居的行为恶劣，或者造成了较大的损失，您可以考虑向公安机关报案。在报案时，请准确说明事件的经过，并提供您所固定的证据。配合警方的调查工作，以便他们能够更好地了解情况并作出处理。

六、提起民事诉讼（作为最终手段）

如果以上步骤都没有能够解决问题，那么您可能需要考虑通过法律途径来维护自己的权益。您可以撰写民事起诉状，明确原被告的信息、诉讼请求、事实和理由，并收集相关的证据。然后，向被告住所地或者侵权行为地的基层人民法院提起诉讼。等待法院的审理和判决，以维护自己的合法权益。

总结与建议：

面对邻居拔树这样的侵权行为，首先尝试通过沟通和协商来解决是一个比较好的选择。如果协商无果，再依次寻求基层组织、人民调解委员会的调解。在必要时，不要害怕拿起法律武器来维护自己的权益。在整个过程中，固定证据是关键，而保持冷静和理性则有助于问题的顺利解决。希望这些建议能够对您有所帮助。