能立案的案子在某些情况下最后确实可能会被撤销，但具体取决于案件的性质、诉讼阶段以及相关法律规定。以下是对此问题的详细解析：
一、刑事案件
自诉案件：
- 撤诉条件：自诉人在宣告判决前，有权与被告人自行和解或撤回自诉。若撤诉确属自愿且未损害国家、集体或他人利益，法院将准许撤诉，案件随之撤销。
- 实例说明：如轻微的侮辱、诽谤案中，双方达成和解后，自诉人可申请撤诉，法院一般会准许。
公诉案件：
- 侦查阶段：若公安机关发现案件无犯罪事实或犯罪事实显著轻微不需追究刑事责任，如财物被盗报案后因记错放置位置而发现并无盗窃行为，公安机关核实后将撤销案件，并立即释放已逮捕的犯罪嫌疑人。
- 审查起诉阶段：人民检察院对公安机关移送起诉的案件进行审查，认为犯罪嫌疑人无犯罪事实或有《刑事诉讼法》规定的特定情形（如情节显著轻微、危害不大等），将作出不起诉决定，相当于撤销案件。同时，对于犯罪情节轻微不需判处刑罚或免除刑罚的，也可作出不起诉决定，并立即释放在押的被不起诉人。
二、民事案件
- 撤诉权利：原告在法院宣判前有权申请撤诉，是否准许由人民法院裁定。只要撤诉不损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益，法院通常将裁定准许撤诉，案件随之撤销。
- 实例说明：如原被告双方在立案后达成和解协议，原告可向法院申请撤诉，法院一般会准许。
三、行政案件
- 申请撤诉：原告在法院对行政案件宣告判决或裁定前，有权申请撤诉；或被告改变行政行为后，原告同意并申请撤诉。是否准许同样由人民法院裁定。
- 实例说明：如行政相对人对行政处罚不服提起行政诉讼，后行政机关重新作出合理决定，行政相对人可申请撤诉，法院经审查后将决定是否准许撤诉。
四、撤销案件的程序与注意事项
- 严格遵循法律程序：无论是公安机关、检察院还是法院，在撤销案件时均需遵循严格的法律程序。
- 通知相关方：撤销案件后，应及时通知相关当事人及案件移送机关。
- 处理涉案财物：对于涉案财物，应按照法律和有关规定进行处理，确保当事人的合法权益得到保障。
五、撤销案件后的法律后果
- 刑事案件：若立案后最终撤销案件，且犯罪嫌疑人未被认定有罪，通常不会留下案底（即犯罪记录）。但若犯罪嫌疑人曾被刑事拘留、逮捕等，公安机关内部可能有相关记录，不过这种记录并非严格意义上的“案底”，对个人在就业、升学等方面的不利影响较小。
- 民事案件：民事案件立案后，无论是撤诉还是正常审理结案，都不会留下刑事意义上的案底。但相关的民事裁判文书等信息可能会在司法系统数据库留存，这可能对个人信用产生一定影响，如在商业信誉评估中被参考。
总结与建议：
能立案的案子在符合特定条件和法律程序的情况下是可以撤销的。当事人在考虑撤销案件时，应充分了解相关法律法规和程序要求，以确保自身权益得到充分保护。如果你有具体的案件或法律问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律分析和解决方案。