快递50条真烟被扣，可能面临行政处罚，甚至刑事责任，具体后果需根据实际情况判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、行政处罚角度
法律依据：
- 根据《中华人民共和国烟草专卖法》及其实施条例，运输烟草专卖品必须持有烟草专卖行政主管部门或者烟草专卖行政主管部门授权的机构签发的准运证。无准运证或者超过准运证规定的数量托运或者自运烟草专卖品的，由烟草专卖行政主管部门处以罚款，并可以按照国家规定的价格收购违法运输的烟草专卖品。
处罚标准：
- 对于无准运证运输烟草专卖品的行为，烟草专卖行政主管部门会视情节轻重给予处罚。一般来说，处罚包括没收违法运输的烟草专卖品和违法所得，并处以罚款。罚款的数额根据违法运输的烟草专卖品的价值、数量以及情节严重程度等因素确定。
- 具体到50条真烟的情况，由于数量较大，很可能被视为情节严重，从而面临较高的罚款，甚至可能被没收全部违法运输的烟草。
二、刑事责任角度
非法经营罪：
- 如果快递的50条真烟属于无证经营或超出经营范围的情况，且情节严重，可能构成非法经营罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，非法经营罪是指违反国家规定，非法经营，扰乱市场秩序，情节严重的行为。
- 量刑标准：对于非法经营罪，根据情节的严重程度，可能面临五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。
其他相关罪名：
- 如果快递过程中存在伪造、变造、买卖国家机关公文、证件、印章等行为，或者存在其他违法犯罪行为，还可能构成其他相关罪名，如伪造、变造、买卖国家机关公文、证件、印章罪等。
三、实际操作中的注意事项
配合调查：
- 如果快递的50条真烟被扣，应积极配合相关部门的调查工作，如实说明情况，提供相关证据和资料。
法律救济：
- 如果对处罚决定不服，可以依法申请行政复议或者提起行政诉讼，维护自己的合法权益。
合规运输：
- 在未来的运输活动中，应确保遵守相关法律法规，持有必要的准运证等文件，避免再次发生类似情况。
总结与建议：快递50条真烟被扣的后果可能涉及行政处罚和刑事责任，具体取决于多种因素，如是否持有准运证、运输数量、情节严重程度等。因此，建议你在遇到此类情况时，及时咨询专业律师（即向我咨询），了解具体的法律后果和应对策略，以便更好地维护自己的合法权益。