结论：员工入职三年没有加班费，可通过收集证据、与公司协商、申请劳动仲裁或提起诉讼等途径来维护自身合法权益。以下为详细分析：

1. 法律依据与加班费性质

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条，有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：
     • 安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
     • 休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
     • 法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
   • 加班费是劳动者因额外工作而应得的报酬，用人单位未支付加班费属于违法行为，劳动者有权要求支付。

2. 收集证据

   • 加班记录：包括加班通知、加班申请单、加班打卡记录等，证明劳动者确实存在加班事实。
   • 工资条：查看工资条中是否包含加班费项目，以及加班费的计算方式和金额是否符合法律规定。
   • 同事证言：如有同事能证明劳动者加班情况，可作为辅助证据。
   • 其他证据：如电子邮件、聊天记录等，证明用人单位安排加班或劳动者提出加班要求。

3. 与公司协商

   • 在收集到足够证据后，劳动者可与公司进行协商，要求支付拖欠的加班费。
   • 协商过程中，劳动者应明确表达自己的诉求，并出示相关证据，以支持自己的主张。
   • 如公司同意支付加班费，双方可签订书面协议，明确支付金额、支付时间等条款。

4. 申请劳动仲裁

   • 如协商无果，劳动者可向当地劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。
   • 申请劳动仲裁时，劳动者需提交仲裁申请书、相关证据材料等。
   • 劳动争议仲裁委员会将依法进行审理，并作出裁决。如用人单位不履行裁决，劳动者可向法院申请强制执行。

5. 提起诉讼

   • 如劳动者对劳动仲裁裁决不服，可在收到裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。
   • 提起诉讼时，劳动者需提交起诉状、相关证据材料等。
   • 人民法院将依法进行审理，并作出判决。如用人单位不履行判决，劳动者可向法院申请强制执行。

6. 注意事项

   • 时效性：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，劳动者应及时主张自己的权利，避免超过时效期间。
   • 保留证据：在整个过程中，劳动者应妥善保留相关证据，以备不时之需。
   • 合法维权：劳动者在维权过程中应遵守法律法规，不得采取过激行为或侵犯他人合法权益。