书面协议扫描成电子版在符合一定条件下是有效的，但其效力可能受到多种因素的影响。以下是对此问题的详细分析：

一、电子扫描版的法律性质

1. 复制件属性：电子扫描版本质上是纸质协议的数字化复制品。在法律上，其效力需结合具体场景判断。若原件存在且可核验，扫描件通常作为辅助证据；若原件灭失且无其他反证，扫描件可能成为关键证据。

2. 形式要求：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，书面合同包括以电子数据交换等形式形成的合同。但需注意，部分特殊合同（如不动产交易合同）可能仍强制要求纸质原件及签字盖章。

二、影响效力的关键因素

1. 真实性验证：

   • 需确认扫描过程未篡改内容。这可以通过哈希值校验或第三方存证平台来增强可信度。
   • 若涉及签名，需区分图片粘贴签名与可靠电子签名的法律效力差异。可靠电子签名具有更高的法律效力。

2. 完整性保障：

   • 扫描文件应完整呈现协议条款，缺失页可能导致效力争议。
   • 建议采用PDF格式并添加防伪水印，以防止内容被替换或篡改。

3. 合法性基础：

   • 协议本身须符合法定形式要件，如特定合同需书面形式。
   • 电子扫描行为不得违反保密义务或侵犯他人知识产权。

4. 举证责任分配：

   • 在纠纷中，主张扫描件效力的一方需提供原始载体（如电脑存储记录）、传输路径等证据链。
   • 对方可通过笔迹鉴定、时间戳比对等方式质疑扫描件真实性。

三、提升效力的实践建议

1. 优先使用电子签约平台：通过法大大、上上签等平台生成具备法律效力的电子合同，这些平台能自动固化签署过程证据，提高合同的可信度和法律效力。

2. 配套补强证据：

   • 保存协议磋商阶段的邮件、聊天记录等，以证明双方的真实意思表示。
   • 通过快递寄送加盖骑缝章的纸质复印件并留存签收凭证，作为辅助证据。

3. 及时公证备案：对重要扫描件进行公证，或在区块链存证平台进行登记，以增强其法律效力。

四、实际应用中的注意事项

• 尽量使用原件：为避免纠纷，建议在签订重要协议时尽量使用原始的书面合同，并妥善保管。原件作为直接证据，其证明力通常更强。
• 补充确认：如果只能使用扫描件，最好在后续能够补充原始合同或者通过其他方式对扫描件的内容进行确认，如双方签署确认函等。
• 法律合规性：确保协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，否则即使扫描件形式合法，协议内容也可能因违法而无效。

示例说明：假设您与一家公司签订了一份书面合作协议，并将该协议扫描成电子版。在后续合作过程中，双方对协议中的某项条款产生了争议。此时，如果您能提供完整的、未被篡改的扫描件，并且该扫描件能够清晰反映双方的真实意思表示，那么该扫描件在法律上是有一定效力的。但为了增强其法律效力，您还可以提供双方在合作过程中的邮件往来、聊天记录等作为辅助证据。

综上所述，书面协议扫描成电子版在符合一定条件下是有效的，但具体效力还需根据具体情况进行判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。