结论：不按招标文件订立合同，2年后才发现是否能处罚，这主要取决于具体的法律规定以及相关证据的保存情况。一般来说，如果超过了法律规定的诉讼时效期间，可能难以直接通过法律途径进行处罚，但并不意味着完全无法采取任何措施。

分析：

1. 诉讼时效问题：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年（特殊情况可能有所不同）。这意味着，如果合同纠纷发生后，权利人在三年内没有提起诉讼或申请仲裁，那么其权利可能不再受法律强制保护。
   • 在您的情况下，如果已经过去了两年，但尚未超过三年诉讼时效期间，那么理论上仍然可以通过法律途径追究违约方的责任。

2. 证据保存问题：

   • 即使未超过诉讼时效期间，要成功追究违约方的责任，还需要有充分的证据来证明对方确实存在不按招标文件订立合同的行为。
   • 如果相关证据已经丢失或无法获取，那么即使提起诉讼或申请仲裁，也可能因为证据不足而无法获得支持。

3. 处罚措施与途径：

   • 如果确实存在不按招标文件订立合同的行为，且未超过诉讼时效期间且有充分证据，那么可以通过法律途径要求违约方承担违约责任，如赔偿损失、继续履行合同等。
   • 如果已经超过了诉讼时效期间或证据不足，那么可能难以直接通过法律途径进行处罚。但此时，仍然可以尝试与违约方进行协商，寻求和解或达成其他补偿协议。

4. 实际操作建议：

   • 首先，尽快收集并整理相关证据，包括招标文件、合同文本、往来函件、会议记录等，以证明对方存在违约行为。
   • 其次，咨询专业律师（如我），对案件进行全面评估，了解具体的法律风险和可能的法律后果。
   • 最后，根据律师的建议和案件的具体情况，决定是否提起诉讼或申请仲裁，或者采取其他合适的措施来维护自己的合法权益。

后续行动建议：

• 如果您发现不按招标文件订立合同的情况，且担心诉讼时效问题，建议尽快采取行动，咨询专业律师并收集相关证据。
• 如果已经超过了诉讼时效期间或证据不足，也不要轻易放弃，仍然可以尝试与违约方进行协商或寻求其他非诉讼途径的解决方案。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。