厂里以废料为由扣钱是否违法，需分情况讨论：
若废料扣钱与员工绩效或责任挂钩，且符合劳动合同及规章制度
- 法律背景：根据《劳动合同法》及相关劳动法规，用人单位有权根据劳动合同的约定以及依法制定的规章制度，对员工进行绩效考核，并据此发放工资或奖金。如果废料处理是员工工作职责的一部分，且劳动合同或规章制度中明确规定了因废料处理不当或造成损失时的扣款条款，那么这种扣款可能是合法的。
- 建议：员工应仔细审查劳动合同和公司的规章制度，了解废料处理与工资扣减的具体规定。如果认为扣款不合理或存在争议，可以与公司进行沟通协商，或者向劳动监察部门投诉。
若废料扣钱缺乏合法依据或违反劳动合同及规章制度
- 法律背景：如果用人单位未经员工同意，擅自以废料为由扣减工资，且这种扣款没有法律依据或违反了劳动合同及规章制度的约定，那么这种行为就是违法的。根据《劳动法》和《劳动合同法》的规定，用人单位应当按时足额支付劳动者的工资，不得克扣或者无故拖欠。
- 可能后果：员工有权要求用人单位补发被扣减的工资，并可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。如果用人单位的行为构成恶意拖欠工资，还可能面临行政处罚或刑事责任。
- 建议：员工应保留好相关证据，如工资条、扣款通知等，以便在需要时证明自己的权益。同时，可以与公司进行协商，要求补发工资；如果协商无果，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
特殊情况：废料处理与员工无直接关联
- 分析：如果废料处理是公司运营过程中的一般性事务，与员工的个人工作职责无直接关联，那么公司以废料为由扣减员工工资就缺乏合理性。这种情况下，扣款行为很可能被视为违法。
- 建议：员工可以明确向公司指出废料处理与自己工作职责的无关联性，并要求公司停止这种违法的扣款行为。如果公司不予理会，员工可以采取上述的投诉或仲裁措施来维护自己的权益。
总结与进一步行动建议：
- 厂里以废料为由扣钱是否违法，取决于扣款行为是否有合法依据、是否符合劳动合同及规章制度的约定，以及废料处理是否与员工个人工作职责有关联。
- 如果员工认为扣款行为违法或存在争议，建议首先与公司进行沟通协商，尝试解决问题。
- 如果协商无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
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