没有营业执照的用人单位与劳动者发生争议时，是否可以申请劳动仲裁需视具体情况而定。以下是从不同角度的详细分析：
一、特定情形下的劳动仲裁
建筑施工、矿山企业违法发包：
- 根据《关于确立劳动关系有关事项的通知》第四条，建筑施工、矿山企业等用人单位若将工程（业务）或经营权发包给不具备用工主体资格的组织或自然人，该组织或自然人招用的劳动者，其用工主体责任由具备用工主体资格的发包方承担。
- 在此类情形下，劳动者可直接将具备用工主体资格的发包方列为被申请人，向劳动仲裁机构申请仲裁。例如，若某建筑公司未取得营业执照，却将工程发包给某包工头，包工头招用的劳动者在发生争议时，可向该建筑公司的上级或具备用工主体资格的发包方申请劳动仲裁。
其他类似情形：
- 类似地，若其他行业也存在违法发包或分包，且发包方具备用工主体资格，劳动者同样可依据此规定申请劳动仲裁。
二、一般情形下的处理方式
劳务关系或雇佣关系：
- 若用人单位未取得营业执照，且不存在上述特定情形，双方通常形成的是劳务关系或雇佣关系，而非劳动关系。
- 在此类情形下，劳动者不能直接通过劳动仲裁程序解决纠纷，因为劳动仲裁主要处理劳动关系中的争议。
民事诉讼途径：
- 劳动者可根据《劳动争议调解仲裁法》的相关规定，通过向人民法院提起民事诉讼的方式，要求无营业执照的用人单位或其出资人支付劳动报酬、赔偿因工作受到的损害等。
- 例如，若某小作坊未取得营业执照，劳动者与其发生工资争议，劳动者可直接向法院提起诉讼，要求小作坊的出资人支付工资。
三、证据的重要性
证明劳动关系：
- 无论是否属于特定情形，劳动者能否申请劳动仲裁的关键在于能否提供充分的证据证明与用人单位之间存在实际劳动关系。
- 证据包括但不限于：劳动合同（如有）、工资条、考勤记录、工作证、同事证言等。这些证据对于确认劳动关系、支持仲裁请求至关重要。
证据收集与保存：
- 劳动者应尽可能收集并保存所有可能证明劳动关系存在的证据，以便在发生争议时能够有力支持自己的主张。
四、具体操作建议
收集证据：
- 劳动者应首先尝试收集并保存所有可能证明劳动关系存在的证据。
确认被申请人身份：
- 若存在特定情形（如建筑施工、矿山企业违法发包），劳动者应确认具备用工主体资格的发包方身份，并将其列为被申请人。
- 若不属于特定情形，但劳动者能提供充分证据证明劳动关系，同样可向劳动仲裁机构申请仲裁，此时被申请人为无营业执照的用人单位（若其存在可追责的主体，如出资人）。
提交仲裁申请：
- 劳动者应准备劳动仲裁申请书、身份证明、证据材料等，并提交到有管辖权的劳动争议仲裁委员会。
- 在提交时，应特别说明用人单位没有营业执照的情况，并提供通过工商查询或其他途径获得的用人单位信息。
关注仲裁进程：
- 劳动者应密切关注仲裁机构的通知和要求，确保按时参加庭审等程序。
考虑民事诉讼：
- 若无法提供足够证据或不属于劳动仲裁受理范围，劳动者应及时向人民法院提起民事诉讼，以维护自身合法权益。
总结来说，没有营业执照的用人单位与劳动者发生争议时，劳动者是否可以申请劳动仲裁取决于具体情形。在特定情形下（如建筑施工、矿山企业违法发包），劳动者可向具备用工主体资格的发包方申请劳动仲裁；在一般情形下，若劳动者能提供充分证据证明劳动关系，同样可以申请劳动仲裁；否则，劳动者可通过向人民法院提起民事诉讼来维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。