商场停车场部分位置限高，在符合相关规定和合理性的前提下，是合法的。以下从不同角度为你详细分析：

从法律法规角度

目前并没有明确的法律法规直接规定商场停车场不能设置限高。不过，商场停车场作为公共场所的一部分，其设置限高应当遵循一些基本原则和规定。例如，限高的设置不能违反消防安全等相关法规。如果限高设置过低，导致消防车辆等无法正常通行，那么这种限高设置就是违法的，因为这可能严重威胁到公共安全。一般来说，消防通道需要保持畅通，其高度等参数有相应的标准要求，商场停车场在设置限高时要确保不影响消防通道的正常使用。

从合理性角度

1. 保障安全：商场停车场设置限高可能是出于安全考虑。比如，停车场内有一些低矮的管道、横梁等设施，如果车辆过高，在行驶过程中可能会碰撞到这些设施，从而引发安全事故。通过设置合理的限高，可以有效避免这种情况的发生，保障停车场内人员和车辆的安全。
2. 规范管理：限高也可以作为一种管理手段，限制某些类型的车辆进入停车场。例如，商场可能希望限制大型货车进入，因为大型货车可能会占用较多的停车位，且在停车场内行驶和停放时可能会对其他车辆和行人造成不便。通过设置限高，可以只允许符合高度要求的车辆进入，从而实现对停车场内车辆类型的管理。

从可能存在的争议角度

1. 限高标识不明显：如果商场停车场设置了限高，但限高标识不明显，导致驾驶员在进入停车场时没有注意到限高信息，从而发生车辆碰撞限高设施等事故，那么商场可能需要承担一定的责任。因为商场有义务确保限高标识清晰、醒目，以便驾驶员能够及时看到并采取相应的措施。
2. 限高设置不合理：如果限高设置过低，没有合理的依据，且对驾驶员的正常通行造成了不必要的困扰，那么这种限高设置可能会引发争议。例如，一些小型客车的高度完全在合理范围内，但因为商场设置了过低的限高而无法进入停车场，这可能会引起驾驶员的不满。在这种情况下，商场可能需要重新评估限高的合理性，并进行相应的调整。

如果你遇到了商场停车场限高相关的问题，比如因为限高导致车辆受损或者认为限高设置不合理等，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议。