股东用持有本公司的债权增资，在符合法定条件和程序的前提下，是合法的。以下从多个角度对此问题进行分析：
一、法律背景与依据
《公司法》的相关规定：
- 根据《公司法》及相关司法解释，股东可以用货币出资，也可以用实物、知识产权、土地使用权等可以用货币估价并可以依法转让的非货币财产作价出资。虽然债权并未直接列举在非货币财产出资的范围内，但法律并未禁止债权出资，只要债权满足“可以用货币估价并可以依法转让”的条件，理论上即可作为出资方式。
债权出资的合法性：
- 债权出资的合法性主要取决于债权的真实性、可转让性以及评估作价的合理性。如果债权是真实存在的，且可以依法转让，同时经过合理的评估作价，那么债权出资就是合法的。
二、债权增资的具体操作与注意事项
债权评估与作价：
- 股东用债权增资时，必须对该债权进行评估作价，确保出资额的合理性。评估应由具有资质的评估机构进行，并出具评估报告。
债权转让与通知：
- 债权出资涉及债权的转让，根据《民法典》的规定，债权人转让债权的，应当通知债务人。未经通知，该转让对债务人不发生效力。因此，在债权增资过程中，必须确保债权转让的通知义务得到履行。
公司章程与股东会决议：
- 债权增资作为公司资本结构的重大变更，通常需要修改公司章程，并经过股东会或股东大会的决议通过。这是确保债权增资合法性和有效性的重要步骤。
工商变更登记：
- 债权增资完成后，公司应及时办理工商变更登记手续，将债权出资的情况反映在公司的注册资本和股东出资情况中。
三、可能存在的法律风险与防范
债权真实性风险：
- 如果债权不真实或存在争议，可能导致债权出资无效，进而影响公司的资本结构和股东权益。因此，在债权增资前，应对债权的真实性进行充分调查和核实。
债权可转让性风险：
- 并非所有债权都可以依法转让。如果债权存在法律上的转让限制（如基于特定身份关系产生的债权），则可能无法作为出资方式。因此，在债权增资前，应确认债权的可转让性。
评估作价风险：
- 债权评估作价的合理性直接影响债权出资的合法性和有效性。如果评估作价过高或过低，都可能引发法律纠纷。因此，应选择具有资质的评估机构进行评估，并确保评估过程的公正性和透明性。
四、实践中的操作建议
完善内部决策程序：
- 在债权增资前，公司应召开股东会或股东大会，就债权增资事项进行充分讨论和表决，确保决策程序的合法性和有效性。
签订债权转让协议：
- 股东与公司应签订债权转让协议，明确债权的转让条件、转让价格、支付方式等关键条款，确保债权转让的合法性和有效性。
及时办理工商变更登记：
- 债权增资完成后，公司应及时到工商行政管理部门办理变更登记手续，将债权出资的情况反映在公司的注册资本和股东出资情况中。
总结与建议：股东用持有本公司的债权增资，在符合法定条件和程序的前提下是合法的。但为确保债权增资的合法性和有效性，公司应完善内部决策程序、签订债权转让协议、及时办理工商变更登记，并充分注意债权真实性、可转让性以及评估作价的合理性等法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。