结论：工厂未满3个月辞工扣钱是否合法，需根据具体情况判断。一般情况下，若用人单位无故克扣劳动者工资，则是不合法的；但在某些特定情况下，如劳动合同中有合法约定或劳动者违反规定，扣钱行为可能合法。以下是对此问题的详细分析：

一、不合法的情况

1. 无约定或约定不明扣钱：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者享有取得劳动报酬的权利，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。
   • 如果工厂与劳动者未在劳动合同中明确约定未干满三个月离职需扣工资的事项，或者以未干满规定时长等理由随意扣钱，这种行为是不合法的。

2. 约定违法扣钱：

   • 即使劳动合同中有相关约定，但如果该约定违反了法律法规的强制性规定，如扣除的工资数额过高导致劳动者生活困难，或违反了劳动法关于最低工资标准的规定，那么扣工资也是不合法的。

3. 未履行法定程序扣钱：

   • 劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，或在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。只要劳动者按照法定程序履行了辞职手续，工厂就应当足额支付劳动者应得的工资。

二、合法的情况

1. 有合法约定扣钱：

   • 如果工厂与劳动者在劳动合同中明确约定了未干满一定期限离职需扣工资的条款，且该约定不违反法律法规的强制性规定（如培训费用扣除等），并且已经过劳动者同意，那么在这种情况下扣工资可能是合法的。但需要注意的是，这种约定必须合理且合法，不能损害劳动者的基本权益。

2. 劳动者违反规定扣钱：

   • 如果劳动者离职时违反了法律法规规定或工厂合法有效的规章制度（如未提前通知给工厂造成损失、违反保密义务、竞业限制等），且工厂的规章制度已经过民主程序制定并向员工公示，那么工厂依据规定扣钱是合法的。但工厂需要提供充分的证据证明劳动者的违规行为以及因此造成的损失。

三、劳动者维权途径

若劳动者认为工厂扣工资的行为不合法，可以采取以下措施维护自己的合法权益：

1. 与工厂协商解决：首先尝试与工厂进行协商，要求返还被克扣的工资。在协商过程中，劳动者可以明确表达自己的诉求和理由，并寻求工厂的理解和支持。

2. 向劳动监察部门投诉：如果协商不成，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。劳动监察部门有权对工厂的违法行为进行查处，并要求工厂返还被克扣的工资。

3. 申请劳动仲裁：若投诉无果，劳动者还可以选择向劳动仲裁机构提起劳动仲裁，要求工厂支付被克扣的工资及可能产生的经济补偿等费用。劳动仲裁机构将根据双方提供的证据和法律规定进行裁决，并保障劳动者的合法权益。

建议：在离职时，劳动者应仔细审查劳动合同中的相关条款，了解自己的权利和义务。如果工厂存在扣工资的行为，劳动者应保留好相关证据（如工资条、劳动合同、离职证明等），并在必要时采取合适的措施维护自己的合法权益。如果还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。