农民承包的土地被征收时，征地补偿协议通常是由市、县人民政府土地行政主管部门（如自然资源局）与村民签订，但在某些委托情形下，也可能由乡（镇）人民政府或其他受委托单位代为签订。以下是对这一问题的详细分析：
一、主要签约主体
市、县人民政府土地行政主管部门：
- 根据《土地管理法》及相关法规，国家征收土地时，由县级以上地方人民政府公告并组织实施。其中，市、县人民政府土地行政主管部门（如自然资源局）是代表政府具体负责征地补偿安置工作的职能部门。
- 这些部门承担着确定征地范围、进行土地调查、拟定补偿安置方案等关键职责，并通常与村民直接签订征地补偿协议。
委托情形下的签约主体：
- 在某些特定情况下，市、县人民政府土地行政主管部门可能会委托乡（镇）人民政府或其他有关单位与村民签订征地补偿协议。
- 此类委托必须基于合法的委托手续，并且受委托单位需在委托权限范围内开展工作。重要的是，其签订协议的法律后果最终仍由委托的土地行政主管部门承担。
二、村民应注意事项
确认签约主体合法性：
- 在签订征地补偿协议前，村民务必仔细核实签约主体的合法性和资格，确保是与具有征地权的政府机构或其合法委托的单位签订协议。
- 可以通过查询相关政府部门的公告、文件或咨询当地土地管理部门来确认签约主体的身份。
审查协议条款：
- 村民应认真阅读并理解协议中的各项条款，特别是关于补偿标准、支付方式、安置措施等内容。
- 确保协议中的条款符合法律法规的规定，并且充分保障了自身的合法权益。
了解法律法规和政策：
- 建议村民在签订协议前，主动了解相关法律法规和政策，以便更好地维护自己的合法权益。
- 可以咨询当地土地管理部门或查阅相关法律法规文件来获取准确的信息。
三、法律后果与维权途径
法律后果：
- 如果村民与不具有征地权的单位或个人签订了征地补偿协议，该协议可能因主体不适格而无效。
- 村民可能因此无法获得应有的补偿和安置，甚至可能面临土地被非法征收的风险。
维权途径：
- 如果村民对签约主体或协议内容存在疑问或争议，可以及时向我咨询或寻求其他法律帮助。
- 在必要时，村民可以通过行政复议或行政诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。
总结来说，农民承包的土地被征收时，征地补偿协议的签订主体通常是市、县人民政府土地行政主管部门，但在某些委托情形下也可能由其他单位代为签订。村民在签订协议前应仔细核实签约主体的合法性和资格，并认真审查协议条款。如果有任何疑问或争议，可以直接向我咨询以获取准确的法律意见和指导。