当公司进入破产程序时，其债权债务关系会通过法定程序进行清理和分配，核心处理方式如下：

1. 债权申报与确认

   • 程序启动：公司破产申请被法院受理后，管理人会通知已知债权人并公告，要求债权人在规定期限内（通常为30日至3个月）申报债权。
     
   • 申报内容：债权人需提交债权证明文件（如合同、发票、付款记录等），并说明债权性质（如合同之债、侵权之债、无因管理之债等）、金额及是否附有担保。
     
   • 审查与确认：管理人对申报的债权进行审查，编制债权表并提交债权人会议核查。债权人、债务人对债权表记载有异议的，可向法院提起诉讼确认债权。

2. 债务清偿顺序
   根据《企业破产法》第113条，破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，按以下顺序清偿：

   • 第一顺序：职工债权（工资、医疗/伤残补助、抚恤费用、基本养老保险/医疗保险费用、补偿金等）；
     
   • 第二顺序：社保费用和税款；
     
   • 第三顺序：普通破产债权（如供应商货款、借款等）。
     若财产不足清偿同一顺序债权，按比例分配；有担保的债权（如抵押、质押）优先于普通债权受偿。

3. 特殊债权处理

   • 共益债务：破产程序中为全体债权人利益产生的债务（如继续营业的工资、水电费等），可随时从债务人财产中优先清偿。
     
   • 劣后债权：如股东因滥用权利导致的债权、破产受理后产生的利息等，在普通债权清偿后仍有剩余财产时才可能受偿。
     
   • 无效行为追回：管理人可撤销破产申请前1年内无偿转让财产、以明显不合理价格交易等行为，追回的财产纳入破产财产分配。

4. 破产程序终结后的债务处理

   • 未受偿债权：若破产财产分配完毕仍有未清偿债权，除有担保或法律另有规定外，债务人不再承担清偿责任，债权人不得再向债务人主张权利。
     
   • 追加分配：若破产程序终结后2年内发现债务人有应追回财产或存在其他可供分配财产，债权人可申请追加分配。

建议：若您是债权人，需及时申报债权并参与债权人会议，监督破产程序进展；若您是债务人公司，应配合管理人工作，如实提供财务资料。具体操作中，债权性质认定、清偿比例计算等可能涉及复杂法律问题，可直接向我咨询细节。