在破产重整阶段，企业降低员工工资是否合法，需根据具体情况及法律规定综合判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、法律框架与原则
《企业破产法》的相关规定：
- 根据《企业破产法》第八十二条，重整计划草案应当包括债务人的经营方案、债权分类、债权调整方案、债权受偿方案、重整计划的执行期限、重整计划执行的监督期限以及有利于债务人重整的其他方案。其中，“有利于债务人重整的其他方案”可能包括调整员工薪酬等措施，但需在合法合规的前提下进行。
- 同时，该法强调保护职工的合法权益，如第八十五条规定，债务人的出资人代表可以列席讨论重整计划草案的债权人会议，但重整计划草案涉及出资人权益调整事项的，应当设出资人组，对该事项进行表决，且职工权益应得到妥善安排。
《劳动合同法》的相关规定：
- 根据《劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容，包括工资等。这意味着，在破产重整阶段，企业若想降低员工工资，原则上需与员工协商一致。
- 若企业未经协商单方面降薪，可能构成违法变更劳动合同，员工有权要求企业补发工资差额或解除劳动合同并要求经济补偿。
二、实际操作中的合法性判断
协商一致的情况：
- 若企业在破产重整阶段与员工就降薪事宜进行了充分协商，并达成了书面协议，那么这种降薪行为是合法的。
- 协商过程中，企业应确保员工充分了解降薪的原因、幅度、期限等关键信息，并尊重员工的知情权、协商权和选择权。
未经协商或协商未果的情况：
- 若企业未经与员工协商或协商未果就单方面降薪，那么这种行为可能构成违法。
- 员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求企业补发工资差额或解除劳动合同并要求经济补偿。
三、特殊情况下的合法性考量
政府或法院介入的情况：
- 在某些特殊情况下，如政府或法院为了推动企业重整成功而介入调整员工薪酬，这种调整可能具有合法性。
- 但即便如此，也应确保调整过程公开透明、公平合理，并充分保障员工的合法权益。
企业濒临破产且无法支付全额工资的情况：
- 若企业确实濒临破产且无法支付全额工资，可以尝试与员工协商降低工资标准或延期支付工资。
- 但这种情况下，企业仍需确保降薪幅度合理、不违反最低工资标准等法律规定，并尽快通过重整计划恢复盈利能力以保障员工权益。
四、法律建议
对于企业而言：
- 在破产重整阶段，若需调整员工薪酬，应提前与员工进行充分协商并达成书面协议。
- 协商过程中应尊重员工的权益和意见，确保调整过程合法合规。
- 若无法与员工达成一致意见，应寻求法律途径解决争议，避免单方面降薪引发法律风险。
对于员工而言：
- 若企业提出降薪要求，应要求企业提供充分的理由和依据，并仔细阅读协商协议内容。
- 若认为降薪行为违法或不合理，有权拒绝并寻求法律援助或申请劳动仲裁维护自身权益。
总结来说，破产重整阶段企业降低员工工资是否合法取决于是否遵循了法律规定和协商程序。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。