结论：军婚函调表女方领导签字自己写了“同意”，且已经领证，这一行为本身并不直接构成违法，但可能存在程序上的瑕疵或不合规之处，具体需结合实际情况判断。以下从多个角度进行分析：

一、军婚函调表的性质与目的

军婚函调表是军队在审批军人婚姻时，为了解军人配偶的政治、社会背景等情况而要求填写的一种表格。其目的在于确保军人的婚姻符合军队的相关规定，维护军队的稳定和安全。因此，函调表的填写应当真实、准确，并经过相关部门的审核和确认。

二、女方领导签字的性质与要求

在军婚函调表中，女方领导的签字通常是对女方政治、社会背景等情况的一种确认或证明。这一签字应当基于领导对女方的了解，并经过核实后作出。如果领导自己写了“同意”并签字，而没有进行充分的核实或了解，那么这一签字可能缺乏真实性和准确性。

三、自己签字可能存在的问题

1. 程序瑕疵：如果女方领导并未实际了解或核实女方的情况，而是自己随意填写了“同意”并签字，那么这一行为可能违反了军婚函调表的填写程序和要求，存在程序上的瑕疵。
2. 真实性存疑：自己签字的“同意”可能无法真实反映女方的政治、社会背景等情况，从而影响军队对军人婚姻的审批和判断。
3. 潜在风险：如果女方存在不符合军队婚姻规定的情况，而领导却自己签字“同意”，那么这一行为可能给军队和军人带来潜在的风险和隐患。

四、已经领证后的法律后果

1. 婚姻效力：尽管函调表填写可能存在瑕疵，但已经领证意味着婚姻关系已经成立。在一般情况下，婚姻关系的成立并不因函调表填写瑕疵而无效。
2. 责任追究：如果军队或相关部门在后续审查中发现函调表填写存在严重问题或虚假情况，可能会追究相关人员的责任，包括女方领导和可能涉及的其他人员。但这一责任追究通常针对的是填写过程中的违规行为，而非已经成立的婚姻关系。

五、建议与措施

1. 如实填写：在未来的军婚函调表填写过程中，应确保所有信息的真实性和准确性，避免自己随意填写或伪造信息。
2. 加强审核：相关部门应加强对军婚函调表的审核力度，确保所有信息都经过核实和确认，避免存在程序瑕疵或不合规之处。
3. 咨询与沟通：如果在填写过程中遇到疑问或不确定的情况，应及时向相关部门或专业人士咨询和沟通，以确保填写的准确性和合规性。

最后，虽然自己签字在军婚函调表上可能并不直接构成违法，但为了避免潜在的风险和隐患，建议严格按照规定和程序进行填写和审核。如果你或他人在此过程中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。