关于农村土地是由村集体还是村小组管理的问题，这实际上取决于土地的具体所有权归属以及相关的法律规定。以下是对此问题的详细解答：
一、土地所有权归属原则
在我国，农村土地主要属于集体所有。这个“集体”可以是乡（镇）农民集体、村农民集体，或是村内两个以上农村集体经济组织的农民集体。因此，土地的管理主体也会因土地所有权归属的不同而有所差异。
二、村农民集体所有的情况（通常由村委会代表行使管理权）
历史演变：当土地在土地改革、农业合作化及人民公社时期统一归村集体组织经营管理，且未进一步划分到村内各个小组时，经过长期的历史演变和法律确认，该土地所有权归村农民集体所有。
管理主体：村委会作为村农民集体的代表机构，负责依法行使土地所有权，包括发包集体土地、决定土地收益分配等。在这种情况下，土地的管理权主要由村委会行使。
三、村内各农村集体经济组织所有的情况（通常由村小组代表行使管理权）
历史与管理实践：若土地历史上就以村小组为单位进行经营和管理，或已经明确分别属于村内两个以上农村集体经济组织的农民集体所有，则这些土地的所有权归各自村小组的农民集体。
管理主体：村小组作为这些农民集体的代表机构，有权依法行使土地所有权，如进行土地发包、制定使用规划等。在这种情况下，土地的管理权主要由村小组行使。
四、如何判断土地的具体归属与管理主体
查阅土地登记资料：首先，应查阅相关的土地登记资料，了解土地的历史演变和现实使用情况。这是判断土地所有权归属的重要依据。
了解土地管理实践：其次，若土地已明确分配给各个村小组或由村小组独立支配，则所有权归村小组；若土地由村集体统一管理和使用，如村里的公共用地、基础设施用地等，则所有权通常归村农民集体。
咨询相关部门：对于存在疑问的情况，建议直接咨询当地的自然资源主管部门或相关法律机构，以获得最准确的答案和专业的法律建议。
五、总结与建议
综上所述，农村土地的管理主体取决于土地的具体所有权归属。在大多数情况下，土地由村农民集体所有，由村委会代表行使管理权；但在某些情况下，土地可能由村内各农村集体经济组织所有，由村小组代表行使管理权。为确保土地权益的合法性和合理性，建议相关管理主体在履行职责时务必遵循法律程序，加强民主监督，并咨询专业律师或相关部门的意见。