厂房没有合法手续，并不意味着租赁合同就完全不受保护，但确实会面临诸多法律风险和限制。以下从不同角度为你详细分析：
一、合同效力角度
合同可能部分无效：
- 根据《民法典》的相关规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。如果厂房没有合法的建设手续，如未取得建设工程规划许可证等，那么基于该厂房签订的租赁合同可能因违反强制性规定而被认定为部分无效，即关于租赁厂房的条款可能无效。
- 但需要注意的是，合同部分无效并不影响其他部分的效力。如果租赁合同中除了厂房租赁外，还包含了其他合法的内容，如设备租赁、服务提供等，这些部分可能仍然有效。
合同可能完全无效：
- 在极端情况下，如果厂房的建设和存在本身就严重违反了法律法规，如属于违法建筑或存在严重的安全隐患，那么整个租赁合同可能被认定为完全无效。
二、法律风险角度
面临行政处罚：
- 出租没有合法手续的厂房，出租方可能面临行政处罚，如罚款、责令拆除或没收违法所得等。这将对出租方的经济利益造成直接损失。
承租方权益受损：
- 对于承租方来说，租赁没有合法手续的厂房可能面临被责令搬迁、停产停业等风险。这不仅会影响承租方的正常经营，还可能导致其遭受经济损失。
合同履行困难：
- 由于厂房没有合法手续，双方在合同履行过程中可能面临诸多困难，如无法办理相关证照、无法享受政策优惠等。这将增加合同履行的不确定性和风险。
三、法律建议
核实厂房手续：
- 在签订租赁合同前，双方应仔细核实厂房的建设手续是否齐全、合法。这包括查看建设工程规划许可证、施工许可证等相关文件。
明确合同条款：
- 在租赁合同中，双方应明确约定厂房的手续情况、租赁期限、租金支付方式、违约责任等条款。特别是要约定如果因厂房手续问题导致合同无效或无法履行的责任承担方式。
寻求法律帮助：
- 如果对厂房的手续情况存在疑虑或争议，双方可以寻求专业律师的帮助。律师可以协助双方进行法律尽职调查，评估合同风险，并提供法律意见和建议。
考虑替代方案：
- 如果厂房确实没有合法手续，且无法通过合法途径补办相关手续，那么双方应考虑寻找其他合法的租赁场所或替代方案，以避免潜在的法律风险和经济损失。
总结来说，厂房没有合法手续并不意味着租赁合同就完全不受保护，但确实会面临诸多法律风险和限制。因此，在签订租赁合同前，双方应仔细核实厂房的手续情况，并明确合同条款以规避潜在风险。如果遇到法律问题或争议，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。