结论：去银行签存款协议时，一般不建议使用合同专用章，而应使用公章或财务专用章，但具体需根据银行要求及协议性质判断。以下为详细分析：

1. 合同专用章的适用范围
   合同专用章通常用于企业对外签订经济合同，其效力范围限于合同类文件。根据《民法典》第四百九十条，合同自当事人签字或盖章时成立。若银行明确允许使用合同专用章，且该章已备案，则法律上有效。但实践中，存款协议属于银行标准格式合同，银行更倾向使用公章或财务专用章以体现权威性。

2. 银行协议的盖章惯例
   存款协议涉及资金存管、利率等核心条款，银行为规避风险，通常要求加盖公章（代表企业法人意志）或财务专用章（涉及资金往来）。若用户主动要求使用合同专用章，可能被银行拒绝或要求补充授权文件，导致流程延误。

3. 例外情形与建议

   • 分支机构盖章：若银行分支机构签订协议，需确认其是否持有独立合同专用章及授权文件。
     
   • 电子协议：若通过银行APP或网银签订电子协议，通常采用电子签名或数字证书，无需实体章。
     
   • 操作建议：签订前可向银行工作人员确认可接受的印章类型，避免因用章错误导致协议无效或重新签署。

总结：为确保协议效力及流程顺畅，建议优先按银行要求使用公章或财务专用章。若对用章有特殊需求，可提前与银行沟通并留存书面确认文件。如有进一步疑问，欢迎随时向我咨询。