购房合同和协议书在一定条件下可以作为证明，但无法完全替代发票的法律效力，需结合其他证据形成完整证据链。以下从法律效力和实务操作两个角度展开分析：

一、法律效力层面

1. 购房合同与协议书的证明力
   根据《民法典》第469条，书面合同是证明双方权利义务关系的主要证据。购房合同和协议书若具备以下要素，可作为交易真实性的核心证明：
   
   • 双方主体信息（姓名、身份证号、联系方式）
     
   • 房屋坐落位置、面积、价款等核心条款
     
   • 双方签字或盖章（需与备案信息一致）
     
   • 交易时间节点（如付款方式、交付时间）
     

例外情形：若合同存在重大瑕疵（如未签字、条款矛盾、价格明显低于市场价），可能被认定为无效或可撤销合同。

1. 发票的不可替代性
   根据《发票管理办法》第19条，发票是法定付款凭证，具有以下特殊效力：
   
   • 证明卖方已履行纳税义务
     
   • 作为买方办理产权登记的必备材料（部分地区要求）
     
   • 在税务稽查中作为交易合法性的直接证据
     

实务风险：若无法提供发票，可能面临以下后果：

• 税务机关追缴税款及滞纳金
  
• 产权登记部门拒绝受理过户申请
  
• 诉讼中需承担更重的举证责任

二、实务操作建议

1. 证据补强方案

   • 银行流水：调取与合同约定时间匹配的转账记录，证明资金流向
     
   • 收据/付款凭证：收集卖方出具的收款证明（需签字或盖章）
     
   • 证人证言：寻找中介、邻居等第三方见证交易过程
     
   • 物业交割证明：如水电费过户记录、物业费缴纳凭证
     

2. 特殊场景处理

   • 小产权房交易：因本身违反《土地管理法》第63条，合同可能被认定无效，此时发票缺失的证明风险更高，需重点收集实际占有使用的证据（如装修合同、物业费票据）
     
   • 继承/赠与场景：若涉及无偿取得，需补充公证文书或亲属关系证明
     

3. 风险防范措施

   • 立即向卖方发出书面催告函，要求补开发票或出具书面说明
     
   • 对现有证据进行公证固定（如合同公证、转账记录公证）
     
   • 咨询专业律师评估诉讼风险，必要时提起确认合同效力之诉
     

提示：证据效力需结合具体案情判断，建议携带全部材料面谈分析。若涉及金额较大或产权争议，可进一步提供交易细节（如付款方式、房屋性质等），我将协助制定专项举证方案。