手写分居协议在符合法定条件时是有效的。以下从不同角度为你详细分析：

有效性条件

1. 双方真实意思表示：分居协议必须基于双方自愿、平等的基础上签订，任何一方不得通过欺诈、胁迫等手段迫使对方签署。例如，一方以威胁对方人身安全的方式要求签署分居协议，这样的协议因非真实意思表示而无效。
2. 内容合法合规：协议内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。比如，协议中约定一方在分居期间不得与他人交往，这种限制人身自由的条款是无效的。同时，协议中关于财产分割、子女抚养等条款也应符合法律规定。
3. 具备民事行为能力：签署分居协议的双方必须具备完全民事行为能力。如果一方是无民事行为能力人或限制民事行为能力人，其签署的分居协议可能因主体不适格而无效。例如，一方因精神疾病无法辨认自己的行为，其签署的分居协议就不具有法律效力。

法律效力范围

1. 对内效力：对于签署协议的双方而言，分居协议具有法律约束力。双方应按照协议的约定履行各自的义务，如一方违反协议约定，另一方可以依据协议主张权利。例如，协议中约定一方在分居期间负责支付子女的生活费，若该方未履行支付义务，另一方可以要求其支付。
2. 对外效力：分居协议一般不具有对抗第三人的效力。例如，在分居期间，一方以个人名义对外负债，债权人仍有权要求另一方承担连带责任，除非债权人明知该分居协议的存在且同意由负债方单独承担债务。

注意事项

1. 书面形式：虽然手写分居协议在形式上可能不如打印的规范，但只要符合上述有效性条件，同样具有法律效力。不过，为了确保协议的清晰性和可保存性，建议尽量使用打印件，并由双方签字确认。
2. 公证与见证：如果条件允许，可以对分居协议进行公证或邀请第三方见证。公证可以增强协议的证明力，在发生纠纷时更容易被法院采信；第三方见证也可以在一定程度上证明协议的真实性和合法性。
3. 及时更新与补充：随着分居时间的推移和情况的变化，双方可能需要对分居协议进行更新或补充。例如，子女的抚养费用可能因物价上涨而需要调整，此时双方可以协商一致后对协议进行修改。

建议：在签署手写分居协议前，双方应充分了解相关法律规定，确保协议内容合法合规。如有需要，可以咨询专业律师，以确保协议的有效性和可执行性。如果你有进一步的法律问题或需要具体的法律帮助，可以直接向我咨询。