政府要求变更拆迁补偿协议的诉讼时效一般为三年，自权利人知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。以下从不同角度进行详细分析：

诉讼时效的法律依据

根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条：“向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。”

诉讼时效的起算点

在政府要求变更拆迁补偿协议的情境中，诉讼时效的起算点通常是从权利人（即被拆迁人）知道或应当知道政府提出变更要求，且该变更要求损害了其合法权益之日起计算。例如，如果政府通过正式文件或通知形式向被拆迁人提出了变更拆迁补偿协议的要求，并且被拆迁人收到了该文件或通知，那么从收到之日起，诉讼时效就开始计算。

诉讼时效的中断与中止

1. 诉讼时效中断：在诉讼时效期间内，如果因法定事由（如权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务、权利人提起诉讼或申请仲裁等）导致诉讼时效中断，那么从中断时起，诉讼时效期间重新计算。
2. 诉讼时效中止：在诉讼时效期间的最后六个月内，如果因法定事由（如不可抗力、权利人丧失民事行为能力且无法定代理人等）导致权利人不能行使请求权，那么诉讼时效中止。自中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。

特殊情况下的诉讼时效

虽然一般情况下诉讼时效为三年，但在某些特殊情况下，如涉及不动产的物权请求权等，可能不受诉讼时效的限制。然而，在政府要求变更拆迁补偿协议的情境中，通常涉及的是合同变更请求权，因此应适用一般的三年诉讼时效规定。

应对建议

1. 及时主张权利：如果被拆迁人认为政府提出的变更要求损害了其合法权益，应及时向政府提出异议，并保留好相关证据（如书面通知、沟通记录等）。
2. 咨询专业律师：在涉及法律纠纷时，及时咨询专业律师以了解自身权益和诉讼策略是非常重要的。虽然此处不直接推荐咨询，但作为被拆迁人，你有权向我咨询相关法律问题。
3. 注意诉讼时效：被拆迁人应密切关注诉讼时效的起算点和期间，避免因超过诉讼时效而丧失胜诉权。