关于占用水库收取水费是否违法及处罚依据的问题，需分情况讨论：
一、合法占用水库并收取水费的情况
法律依据：
- 根据《中华人民共和国水法》第四十八条：“直接从江河、湖泊或者地下取用水资源的单位和个人，应当按照国家取水许可制度和水资源有偿使用制度的规定，向水行政主管部门或者流域管理机构申请领取取水许可证，并缴纳水资源费，取得取水权。但是，家庭生活和零星散养、圈养畜禽饮用等少量取水的除外。”
- 若占用水库的行为已经获得了水行政主管部门的取水许可，并按照规定缴纳了水资源费，那么在此情况下收取水费（通常指对使用水库水资源的其他单位或个人收取的费用，需明确该费用性质及合同约定）可能是合法的，但需确保收费行为符合相关法律法规及合同约定。
合法性判断：
- 合法占用水库并收取水费的关键在于是否取得了合法的取水权，并按照规定缴纳了相关费用。同时，收费行为需有明确的法律依据或合同约定，且不得违反法律法规的强制性规定。
二、非法占用水库并收取水费的情况
违法行为认定：
- 若未取得水行政主管部门的取水许可，擅自占用水库并收取水费，则构成违法行为。这种行为不仅违反了《中华人民共和国水法》的相关规定，还可能涉及非法经营、诈骗等刑事犯罪（视具体情况而定）。
处罚依据：
- 行政处罚：根据《中华人民共和国水法》第六十九条：“有下列行为之一的，由县级以上人民政府水行政主管部门或者流域管理机构依据职权，责令停止违法行为，限期采取补救措施，处二万元以上十万元以下的罚款；情节严重的，吊销其取水许可证：（一）未经批准擅自取水的；（二）未依照批准的取水许可规定条件取水的。” 对于非法占用水库并收取水费的行为，水行政主管部门可以依据此条款进行处罚。
- 刑事处罚：若非法占用水库并收取水费的行为情节严重，构成犯罪的，将依法追究刑事责任。例如，若以非法占有为目的，通过虚构事实或隐瞒真相的方法骗取他人财物，数额较大的，可能构成诈骗罪。
三、特殊情况说明
- 农村集体经济组织成员使用本集体经济组织的水塘、水库中的水：根据《中华人民共和国水法》的相关规定，农村集体经济组织及其成员使用本集体经济组织的水塘、水库中的水，通常不需要申请取水许可，但应遵循节约用水、保护水资源的原则。在此情况下，若农村集体经济组织或其成员向外部单位或个人收取水费，需确保收费行为符合相关法律法规及村规民约，且不得损害集体利益和其他成员的合法权益。
建议：
- 若您或他人涉及占用水库并收取水费的行为，请务必确保该行为合法合规，取得必要的取水许可并缴纳相关费用。
- 若发现非法占用水库并收取水费的行为，应及时向当地水行政主管部门或公安机关举报，以维护水资源管理秩序和公共利益。
- 在处理此类问题时，建议咨询专业律师或相关机构以获取更具体的法律意见和帮助。
如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。