在劳务派遣关系中，劳务派遣员工的工资一般应由劳务派遣单位发放。以下是对这一问题的详细分析：
一、劳务派遣关系中的主体与责任
劳务派遣关系涉及三方主体：劳务派遣单位、用工单位和被派遣劳动者。其中，劳务派遣单位是用人单位，应当履行用人单位对劳动者的义务，包括支付劳动报酬。用工单位则是实际使用劳动者的单位，它需要向劳务派遣单位支付包括被派遣劳动者的劳动报酬在内的相关费用。
二、法律规定与工资支付
劳务派遣单位的支付义务：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十八条，劳务派遣单位应当按月向被派遣劳动者支付劳动报酬。
- 被派遣劳动者在无工作期间，劳务派遣单位应当按照所在地人民政府规定的最低工资标准，向其按月支付报酬。
- 劳务派遣单位不得克扣或截留用工单位支付的劳动报酬，必须如实、足额地发放给被派遣劳动者。
用工单位的支付责任：
- 用工单位需要按照劳务派遣协议向劳务派遣单位支付包括被派遣劳动者的劳动报酬在内的相关费用。
- 用工单位有监督劳务派遣单位是否按时、足额发放劳动者工资的义务，发现问题应及时沟通解决，以保障劳动者合法权益。
三、特殊情况与劳动者权益保护
- 在实际操作中，虽然存在用工单位直接支付给派遣员工工资的情况，但这主要是为了避免不法派遣单位卷款而逃，从而保障劳动者的权益。然而，这种情况并不改变劳务派遣单位作为用人单位应履行支付报酬义务的法律事实。
- 若劳务派遣单位未按时足额发放工资，劳动者可以依法向其主张权利，要求支付工资及相应赔偿。劳动者在遇到工资问题时，应首先尝试与劳务派遣单位协商解决；协商不成时，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或向人民法院提起诉讼。
四、实际建议
- 对于劳动者：在签订劳务派遣合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于劳动报酬的支付方式和时间等条款，确保自己的权益得到保障。如果遇到工资问题，应及时与劳务派遣单位沟通，并保留好相关证据，以便在必要时维护自己的合法权益。
- 对于用工单位：在选择劳务派遣单位时，应选择信誉良好、管理规范的单位进行合作。同时，应加强对劳务派遣单位的监督和管理，确保其按时、足额发放劳动者工资，避免因此引发劳动争议和法律风险。
综上所述，劳务派遣员工的工资一般应由劳务派遣单位发放。如果在实际操作中遇到特殊情况或问题，劳动者和用工单位都应及时咨询专业律师或相关机构，以便更好地维护自己的合法权益。如果你有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。