在高速公路上驾驶摩托车时速达到90公里/小时是否会被罚款，需分情况讨论：

1. 若该高速公路允许摩托车行驶且限速高于90公里/小时
   根据《道路交通安全法》及地方性法规，高速公路的限速标准通常为60-120公里/小时（具体以路段标志为准）。若摩托车在允许行驶的路段上，且该路段限速高于90公里/小时（例如限速100公里/小时），则时速90公里/小时属于合法范围，不会被罚款。但需注意保持安全车距、佩戴头盔等法定要求。

2. 若该高速公路允许摩托车行驶但限速低于90公里/小时
   若路段限速为80公里/小时，则时速90公里/小时已超速12.5%。根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》：

   • 超速10%-20%的，处警告或20-200元罚款，并记3分（具体以地方规定为准）；
   • 若限速更低（如60公里/小时），超速50%以上（即90公里/小时）可能面临吊销驾照、200-2000元罚款，并记12分。

3. 若该高速公路禁止摩托车行驶
   部分省份（如四川、海南等）明确禁止摩托车进入高速公路。若违反禁令标志行驶，即使未超速，也会因“违反禁令标志”被处20-200元罚款，并记3分。若同时超速，将叠加处罚。

建议：

• 驾驶前确认当地高速公路是否允许摩托车通行（可通过交管部门官网或高速入口标志查询）；
• 严格遵守路段限速标志，摩托车在高速上通常需靠最右侧车道行驶；
• 超速处罚可能因地区执法力度差异而有所不同，但法律风险客观存在。

如有进一步细节（如具体省份、路段限速等），可补充说明后为您分析更精准的处罚依据。