在交叉办理的违纪案件中，违纪资金的追缴主体通常取决于案件的具体性质、办理机关以及相关法律法规的规定。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

1. 案件性质与办理机关：

   • 如果违纪案件主要由某一特定机关（如纪检监察机关）负责办理，且该案件不涉及其他机关的交叉管辖，那么违纪资金的追缴通常由该办理机关负责。
   • 在交叉办理的情况下，即多个机关（如纪检监察机关与公安机关）共同参与案件办理时，违纪资金的追缴可能需要根据各机关的职责分工和案件的具体情况来确定。一般来说，如果违纪行为同时构成犯罪，公安机关在侦查过程中可能会对涉案资金进行查封、扣押或冻结，并在后续程序中依法处理。而纪检监察机关则可能根据党纪政纪规定，对违纪资金进行追缴或责令退赔。

2. 相关法律法规：

   • 根据《中国共产党纪律处分条例》等相关党纪政纪规定，对于违纪所得的经济利益，应当予以追缴或者责令退赔。这一规定明确了纪检监察机关在违纪案件中对违纪资金的追缴职责。
   • 如果违纪行为同时构成犯罪，那么还需要依据《中华人民共和国刑法》等相关刑事法律规定，对涉案资金进行刑事追缴或没收。在这种情况下，公安机关、检察机关和法院等刑事司法机关将依法行使职权，对违纪资金进行追缴和处理。

3. 实际操作中的考虑：

   • 在实际操作中，违纪资金的追缴可能涉及多个环节和多个机关的协作。例如，纪检监察机关在调查过程中可能发现违纪资金，并依法进行追缴；同时，如果违纪行为涉嫌犯罪，纪检监察机关可能会将案件移送公安机关进行刑事侦查，公安机关在侦查过程中也会对涉案资金进行查封、扣押或冻结等措施。
   • 此外，违纪资金的追缴还需要考虑资金的性质、来源、去向以及违纪行为的情节等因素。对于不同性质的违纪资金（如贪污受贿所得、挪用公款所得等），追缴的方式和程序可能有所不同。

针对您的情况，我建议：

• 如果您是违纪案件的当事人或相关人员，且对违纪资金的追缴有疑问或担忧，建议您及时咨询相关办理机关（如纪检监察机关或公安机关）以获取准确的信息和指导。
• 如果您需要更具体的法律帮助或建议，比如如何准备相关材料、如何配合调查等，也可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况和案件性质，为您提供专业的法律意见和帮助。