由他人代转对公账户是否违法，需根据资金往来的具体性质和用途来判断，不能一概而论。以下从合法与违法两种情形进行详细分析：
合法情形
正常资金代转：若他人代转的资金是合法的，且转账行为符合相关法律法规和银行规定，比如个人因故无法亲自操作转账，委托他人代为将对公账户的款项转入另一对公账户，用于正常的业务往来、还款、支付货款等，这种代转行为是合法的。
委托支付：在商业活动中，有时会出现一方委托另一方代为支付款项的情况。例如，A公司委托B公司代为向C公司支付货款，只要这种委托支付关系有明确的合同或协议支持，且资金来源合法，转账行为也是合法的。
违法情形
洗钱：如果他人代转的资金来源于违法犯罪所得，如贩毒、走私、诈骗等活动的黑钱，并试图通过对公账户进行资金洗白，使其看似合法收入，则构成洗钱罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，犯洗钱罪的将面临严厉的刑事处罚，包括有期徒刑、拘役和罚金等。
偷逃税款：企业或个人通过他人代转对公账户资金，以隐瞒收入、虚构支出等方式少缴税款，违反了《中华人民共和国税收征收管理法》等相关法律法规。这种行为可能导致企业面临补缴税款、加收滞纳金及罚款等处罚，情节严重者还可能被追究刑事责任。
非法经营：在未经国家有关主管部门批准的情况下，擅自从事证券、期货、保险业务或非法从事资金支付结算业务等，涉及的他人代转对公账户资金往来均属违法行为。依据《中华人民共和国刑法》的相关规定，扰乱市场秩序者将面临刑事处罚。
侵占、挪用资金：如果他人代转的资金原本属于企业或个人所有，但代转人利用职务之便或虚构交易等方式将资金非法占为己有或挪作他用，则构成职务侵占罪或挪用资金罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，此类行为将受到相应的刑事处罚。
建议与防范措施
确保资金来源合法：在进行他人代转对公账户资金时，务必确保资金来源合法，避免涉及任何违法犯罪活动。
遵守相关法律法规和银行规定：转账行为应严格遵守相关法律法规和银行规定，确保资金的合法性和透明性。
建立健全的财务管理制度：企业和个人应建立健全的财务管理制度，明确资金流转的合规流程，定期对账，确保资金往来清晰可查。
加强员工法律培训：提高员工的法律意识，防范职务犯罪风险，确保转账行为的合法性和合规性。
总结来说，由他人代转对公账户是否违法，关键在于资金往来的具体性质和用途。在遵守相关法律法规和银行规定的前提下，确保资金的合法性和透明性是关键。如果您在转账过程中遇到任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。